智慧財產及商業法院行政判決110年度行專訴字第68號民國111年8月17日辯論終結原 告 美時化學製藥股份有限公司代 表 人 Vilhelm Robert Wessman訴訟代理人 呂紹凡律師
馬鈺婷律師黃雅君專利師被 告 經濟部智慧財產局代 表 人 洪淑敏訴訟代理人 施雅儀
簡正芳
參 加 人 NOVARTIS AG. 瑞士商諾華公司代 表 人 Robert Carroll Stanley
Hiram Robert Andrews訴訟代理人 牛豫燕律師
莊郁沁律師林蘭君專利師上列當事人間因發明專利舉發事件，原告不服經濟部中華民國110年10月27日經訴字第11006306870號訴願決定，提起行政訴訟，並經本院命參加人獨立參加訴訟，本院判決如下：
主 文訴願決定及原處分關於「請求項2至3舉發不成立」部分均撤銷。
被告就第I406661號發明專利應為「請求項2至3舉發成立」之處分。
訴訟費用由被告負擔。
事實及理由
一、參加人前於民國95年7月19日以「4-甲基-N-〔3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基〕-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺之結晶型」（下稱系爭結晶型）向被告申請發明專利，並聲明以西元2005年7月20日、同年9月12美國60/701,405、60/716,214號專利案主張優先權，經被告實體審查後，於102年5月6日審定准予專利，發給第I406661號發明專利證書（下稱系爭專利）。嗣經原告於109年4月7日以系爭專利請求項第1至4、7、10至13、16、19、22、25、28、31、33及36至38項，違反核准時（即100年12月21日修正公布、102年1月1日施行）專利法第26條第1、2項及第22條第2項規定提起舉發，參加人於同年8月3日申請更正系爭專利範圍，經被告於110年3月26日以（110）智專三（四）01145字第11020279040號專利舉發審定書作成「109年8月3日之更正事項，准予更正」、「請求項1、4、7、10、13、16、1
9、22、25、28、31、33、36舉發駁回」（上開二部分業已確定，以下逕以系爭專利各請求項稱之，不再贅述為系爭專利更正後各請求項）及「請求項2至3、11至12、37至38舉發不成立」之處分（下稱原處分），原告不服，乃就原處分關於上開舉發不成立部分提起訴願，經經濟部於110年10月27日作成經訴字第11006306870號「原處分關於『請求項2至3舉發不成立』部分訴願駁回；原處分關於『請求項11至12、37至38舉發不成立』部分撤銷，由原處分機關於6個月內另為適法之處分」之訴願決定（下稱訴願決定），原告就原處分及訴願決定關於「請求項2至3舉發不成立」部分不服，提起本件行政訴訟。本院認本件判決之結果，倘認原處分及訴願決定，應予撤銷，將影響參加人之權利或法律上之利益，爰依職權命參加人獨立參加訴訟。
二、原告起訴主張略以：
㈠、系爭專利請求項2、3對應之說明書內容違反核准時專利法第26條第1項（可據以實現要件）之規定：
系爭專利雖經准予更正，惟根據系爭專利各請求項可知，系爭專利的系爭結晶型判斷，是藉由圖式所呈現所有被偵測到的粉末X射線衍射法（即XRPD）定性結晶類型表徵，以得知其結晶型種類。有關XRPD定性結晶類型，通常須包含10個（2θ度數）最大值來作為x-射線粉末繞射圖案表徵，方足以使該領域具有通常知識者判定其結晶型。不管是結晶型或非結晶型物質，其XRPD均具有峰值，而結晶型應至少具有數10個峰值，方可有別於仍具有少量峰值之非結晶型。換言之，僅藉由小於或甚至遠小於10個（2θ度數）最大值，不足以明確判斷其結晶型種類。系爭專利對於結晶型A、A'、A"、B、B'、SB、SB'、C、C'、SC及SE等類型的判定，係藉由如其說明書所載至少包含10個左右（2θ度數）最大值作為x-射線粉末繞射圖案表徵加以區分之。若僅就系爭專利請求項2至3以結晶型係二水合物、及具有「至少1個」或「至少4個」之x-射線粉末繞射圖案表徵界定所請，則如何能僅以如此少量峰值（至少1個或至少4個），及藉由單水合物或二水合物，來明確區分包含類似或完全相同峰值表徵之混合結晶型物質中的各個晶型之技術手段，並未揭露於系爭專利說明書，該領域具有通常知識者並無法僅藉由系爭專利說明書之揭露內容，而可據以實現系爭專利請求項2至3所請範圍。又系爭專利說明書是否符合核准時專利法第26條第1項之規定，應係以系爭專利說明書內容整體觀之，而非僅以系爭專利部分請求項所載內容為判定依據，然訴願決定僅以系爭專利說明書已部分記載結晶型A及B之結晶型種類、性質、製備方法及步驟，而認定系爭專利說明書未違反核准時專利法第26條第1項規定，顯有重大違誤，系爭專利違反核准時專利法第26條第1項規定甚明。
㈡、系爭專利請求項2、3違反核准時專利法第26條第2項（明確要件）：
系爭專利所申請者係為「物」的請求項，而非「方法」請求項。根據系爭專利先前技術所載，可清楚得知，系爭專利相較於先前技術，主要技術特徵應在於藉由選擇何種製程條件來製備得不同的結晶型，即系爭專利之特別技術應在於多晶型的製備方法，而非不具任何無法預期功效之多晶型本身。且根據系爭專利各請求項可知，其所請範圍並非是僅針對製備後的結晶型種類，而是針對任何可落入申請專利範圍所載均屬之。再者，系爭專利之晶體判斷，是藉由圖式所呈現所有被偵測到的XRPD表徵，來得知其結晶型種類，而系爭專利請求項2至3，以結晶型係二水化合物、及具有「至少1個」或「至少4個」之不足量，甚至可能與其他結晶型發生範圍重疊的x-射線粉末繞射圖案表徵，來界定所請之晶體結構特徵，實際上根本無法判定所請係何種結晶型之技術特徵，致所請範圍不明確，無法為系爭專利說明書所支持，不符核准時專利法第26條第2項之明確要件。再者，根據系爭專利說明書第12至23頁所揭露的內容，可知系爭專利所申請之鹽酸鹽至少包含結晶型A、A'、A"、B、B'、SB、SB'、C、C'、SC、D及SE等多種晶型種類，其中系爭專利請求項2至3所申請之結晶型A之XRPD最大值，在「±0.2」、「±0.3」之誤差值範圍內，與上開多種結晶型A'產生至少1個、甚至6個數值相同或重疊。訴願決定所認定系爭專利請求項11至12所界定（2θ度數）之XRPD最大值時，會與系爭專利請求項23至24所界定之（2θ度數）之XRPD最大值，在「±0.2」、「±0.3」之誤差值範圍內，產生部分數值相同或重疊，導致無法判讀該結晶究竟為結晶型B或結晶型C，故系爭專利請求項11、12記載不明確而違反核准時專利法第26條第2項之規定；同理，系爭專利請求項2、3所界定之8.5°、11.0°、11.5°、17.2°、1
8.8°、19.2°、20.8°、22.1°及26.0°（2θ度數）之XRPD最大值時，會與上開多種結晶型A'等之XRPD最大值，在「±0.2」、「±0.3」之誤差值範圍內，產生至少1個、甚至6個數值相同或重疊，導致無法判讀該結晶是否為結晶型A或其他晶型，故系爭專利請求項2、3自亦有記載不明確之情形，而違反核准時專利法第26條第2項之規定。
㈢、系爭專利請求項2、3違反核准時專利法第26條第2項（支持要件）：
系爭專利所請之結晶型A、B及C於不同溶劑或溫度下，會互相轉換其結晶型，甚至處於混合二種或三種結晶型狀態，而系爭專利請求項2之結晶型，亦界定只要大於50%結晶之大體上純淨即屬之。系爭專利所請各結晶型主要均處於混合結晶型狀態（包含非結晶、結晶型A、結晶型B及/或結晶型C等）。此時，若該領域有通常知識者欲具有相同或重疊之「至少1個或至少4個之峰值表徵」時，在此有限的條件下，不僅難以區分出該混合結晶型物質是否有大於50%所請結晶型，並且亦難判定該大於50%所請結晶型係為單水合物（例如結晶型B）或二水合物（例如結晶型A）。根據系爭專利所申請之各請求項，可知其所申請之範圍並非僅限定為製備後之結晶型種類，而是針對任何可落入申請專利範圍所載均屬之。更何況該領域具有通常知識者在系爭專利所界定有限的條件中，是否可以明確區分出該混合結晶型物質是否為「大體上純淨」（即大於50%）之所請結晶型，並且由「至少1個或至少4個之峰值表徵」的x-射線粉末繞射圖案，即可判斷為單水合物或二水合物鹽酸鹽，實屬困難，實際上亦無法為說明書所支持。
㈣、甲證11至13之組合足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性：
１、甲證11揭露一種式I之化合物（即舉發證據1第6頁第1段，下稱式I化合物），並揭露式I化合物可為醫藥上可接受之鹽，而該鹽可為式I化合物與有機酸或無機酸所形成之酸加成鹽，並例示該無機酸包括鹽酸。系爭專利請求項2及3與甲證11之差異在於甲證11未具體揭露式I化合物之鹽酸鹽，且未揭露該鹽之結晶型式。然甲證12揭露一種化合物AMN107，即為甲證11之式I化合物（即舉發證據2第130頁之圖1A），並揭露AMN107-AA（即AMN107之鹽酸鹽AMN107-HCl）的藥物動力學數據。由此可見，甲證12已具體揭示甲證11之式I化合物可呈鹽酸鹽形式，亦揭露投與該鹽酸鹽化合物至動物體後之血漿濃度等藥物動力學參數。甲證13則揭露AMN107可用於治療慢性骨髓性白血病（即舉發證據3），且進一步揭露所使用之AMN107為AMN107單鹽酸鹽（甲證13第4942頁右欄第3段），更已揭露可購得該鹽之公開管道。由此可知，於系爭專利申請日前（亦於優先權日前），系爭結晶型已是習知化合物，其鹽酸鹽形式業已用於醫藥用途。系爭專利於其說明書對於多晶型穩定性研究中所載：「而該鹽酸鹽之非結晶型自發結晶為結晶型A」等內容，足見系爭專利所申請之結晶型A，事實上於已知系爭結晶型鹽酸鹽存在時，即同時與非結晶型同時共存。故系爭專利所請之結晶型A即系爭專利請求項2至3，實屬已知化合物，其發明人對該結晶型應僅屬單純的發現，而非發明，相較於甲證11至13應不具進步性。
２、再者，倘若申請專利之發明為已知化合物的多晶型，且未具有無法預期的功效，則該化合物的多晶型亦不具進步性。系爭專利於其說明書【先前技術】一節亦自承多晶型相較於非晶型具有更好的穩定性係為習知技術，系爭專利並未揭露其所請鹽酸鹽化合物之結晶型A、B、C等晶型，就該等性質之實驗比較，具有任何無法預期的效果，而僅於系爭專利說明書探討結晶型A、B、C相較於非結晶型之穩定性（系爭專利說明書第49頁），且參酌核准時專利審查基準第二篇第十三章第5.3.1.3節，系爭專利請求項2至3不具進步性甚明。
㈤、甲證11至14、17之組合足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性：
已知化合物的多晶型是否具有進步性，應證明該多晶型較該已知化合物具有無法預期的功效，就系爭專利而言，其應進一步提供其所請各類結晶型之AMN107鹽酸鹽相較於非結晶型之AMN107鹽酸鹽具有無法預期的功效，否則應認定該些結晶型之AMN107鹽酸鹽不具進步性。而甲證11至13（即舉發證據1至3）已揭示了AMN107鹽酸鹽及其投藥後之藥物動力學和應用，已如前述。甲證14揭露包含AMN107鹽酸鹽等鹽類之化學式1可為水合物、結晶型等形式（本院卷二第476頁，甲證14、14-1第31頁倒數第3段、第63頁實施例92及第51頁實施例68），且甲證17圖1A明確揭示AMN107鹽酸鹽單水合物（NVP-AMN107-AA，甲證17第4501頁圖1A及同頁左下欄），「NVP-AMN107-AA」係為AMN107鹽酸鹽單水合物的應用。甲證11至13既已投藥應用，為已知化合物，因此系爭專利所請結晶型之AMN107鹽酸鹽是否具有無法預期之功效的比較對象理應為非結晶型之AMN107鹽酸鹽，而非為AMN107游離鹼。從而，多晶型相較於非晶型具較佳穩定性本為習知技術，而系爭專利請求項2及3並未證明其所請之AMN107鹽酸鹽之結晶型A，相較於非結晶型之AMN107鹽酸鹽具有無法預期之功效。縱AMN107鹽酸鹽單水合物係為結晶型，AMN107鹽酸鹽單水合物之結晶型至多僅可能為結晶型A、結晶型B及結晶型C，但並不可能係指為二水合物之結晶型A，參酌核准時專利審查基準第二篇第十三章第5.3.1.3節所載，系爭專利請求項2及3不具進步性甚明。
㈥、甲證11至14、17、19之組合；甲證11至14、17、20之組合；甲證11至14、17、21之組合；甲證11至14、17與甲證19至21之組合，均足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性：
１、系爭專利請求項2及3所請實為已知化合物的多晶型，且該些晶型相較於該已知化合物並不具無法預期的功效。甲證19亦教示AMN107鹽酸鹽可為水合物，甲證19、20及21更揭示可藉由溶劑與水的調配而取得鹽酸鹽等鹽類之結晶型水合物。據此，AMN107之鹽酸鹽及其水合物係在系爭專利申請前，即為已知存在的化合物，系爭專利至多僅進一步界定區分該已知化合物AMN107鹽酸鹽之結晶型的種類。是以，就系爭專利而言，其應進一步提供其所請各類結晶型之AMN107鹽酸鹽相較於非結晶型之AMN107鹽酸鹽具有無法預期的功效，否則應認定該些結晶型之AMN107鹽酸鹽不具進步性。依核准時專利審查基準第二篇第十三章第5.3.1.3節規定，系爭專利請求項2及3相較於甲證11、12、13、14、17或其任意組合；或甲證1
1、12、13、14及/或17與甲證19、20及/或21之組合之任意組合，實不具進步性，而違反核准時專利法第22條第2項之規定。
２、承上，甲證19、20及21揭示可藉由溶劑與水的調配而取得鹽酸鹽等鹽類之結晶型水合物。據此，AMN107之鹽酸鹽及其水合物係在系爭專利申請前，即為已知存在的化合物，系爭專利至多僅進一步界定區分該已知化合物AMN107鹽酸鹽之結晶型的種類。專利權人應進一步提供其所請各類結晶型之AMN107鹽酸鹽相較於非結晶型之AMN107鹽酸鹽具有無法預期的功效，否則應認定該些結晶型之AMN107鹽酸鹽不具進步性。多晶型相較於非晶型具較佳穩定性本為習知技術，系爭專利未揭露其相較於非晶型之AMN107鹽酸鹽，具有無法預期的功效。系爭專利並未揭露其所請之鹽酸鹽化合物之結晶型A、B、C等晶型，就該等性質（藥物的貯存期限、溶解度、調配物性質及加工性質）之實驗比較，具有任何無法預期的效果，而僅於系爭專利說明書第49頁探討結晶型A、B、C相較於非結晶型之穩定性，故依核准時專利審查基準第二篇第十三章第5.3.1.3節所載，系爭專利請求項2及3不具進步性甚明。
㈦、並更正訴之聲明為：訴願決定及原處分關於「請求項2至3舉發不成立」部分應撤銷；被告就發明第I406661號專利舉發事件，應作成「請求項2至3舉發成立」之處分；訴訟費用由被告負擔（本院卷二第468頁）。
三、被告答辯略以：
㈠、系爭專利請求項2、3對應之說明書內容未違反核准時專利法第26條第1項（可據以實現要件）之規定：
１、化合物發明之可據以實現要件之審查係根據系爭專利核准當時（102年5月6日）所採102年版發明專利審查基準，其於第二篇第13章第1.1.1.1節記載「關於化合物發明，說明書中應指明所請求之化合物，即應載明該化合物的化學名稱、結構式（包括各種官能基團、分子立體構型等）或分子式，並應記載該化合物之物理、化學性質（例如各種定性、定量數據或光譜圖等），說明書之記載應明確且充分揭露至該發明所屬技術領域中具有通常知識者能確認該化合物的程度……」，而系爭專利說明書已明確且充分揭露各種結晶型化合物的製備方法及其性質，是系爭專利說明書之記載確實已明確且充分揭露至該發明所屬技術領域中具有通常知識者能確認該二水合物結晶型A的程度，且該發明所屬技術領域中具有通常知識者皆知，當結晶型化合物進行X-射線粉末繞射後，所獲得之x-射線粉末繞射圖案會呈現所有被偵測到的XRPD表徵，實無須如所指稱者揭露如何製備僅具有少數峰值表徵的晶體，雖然原告稱「……根據系爭專利各請求項可知，其所請範圍並非是僅針對製備後的結晶型種類，而是針對任何可落入申請專利範圍所載均屬之……」等語，惟並非僅具有「至少1個或至少4個之峰值表徵」之化合物即會落入系爭專利請求項2至3之範圍内，系爭專利請求項2至3實質上為一種特定化合物之二水合物結晶型A，既然系爭專利說明書業已明確且充分揭露該二水合物結晶型A的製備方法及其性質，系爭專利請求項2至3所對應之說明書内容自當符合可據以實現要件，原告所持之理由並不可採。
２、且先前技術即甲證14所揭露之結晶型化合物即屬於一種游離鹼形式，系爭專利已於說明書明確揭露該先前技術及如何製備出系爭結晶型鹽酸鹽如實例23等，非如原告所指稱僅有特定人士才能取得。又系爭專利說明書已明確充分揭露二水合物結晶型A之製備方法及其所具有之x-射線粉末繞射圖案表徵等性質，該發明所屬技術領域中具有通常知識者在系爭專利說明書、申請專利範圍及圖式三者整體之基礎上，參酌申請時之通常知識，無須過度試驗即可據以實現申請專利之發明，因此系爭專利請求項2至3所對應之說明書內容符合核准時專利法第26條第1項之規定。
㈡、系爭專利請求項2、3未違反核准時專利法第26條第2項（明確要件）：
１、根據系爭專利核准當時所採102年版發明專利審查基準，其於第二篇第十三章第4.2.1.1節記載「申請專利之發明為化合物之結晶物時，原則上，請求項應以具有其技術特徵之物理、化學特性，例如X射線粉末繞射、X射線單晶繞射、IR、Ra
man、NMR等光譜分析法、或DTA、TGA、DSC等熱分析方法之數值界定其晶體結構，使該發明所屬技術領域中具有通常知識者足以認定申請專利之發明與先前技術之區別」，由於系爭專利請求項2至3中所述之二水合物結晶型A已由具有至少1個或4個選自特定數值(2θ度數)之最大值之x-射線粉末繞射圖案所表徵，且亦能與先前技術有所區別，自當符合明確要件。
２、系爭專利說明書實施例25主要係藉由10種不同溶劑分別對於各結晶型（A、B及/或C)會如何互相轉變進行平衡研究，第49頁係觀察在極端貯存條件下各結晶型之穩定性，並非表示結晶型A、B或C於製備出後會處於混合結晶型狀態，事實上系爭專利之說明書已詳盡說明如何製備出大體上純淨之各特定結晶型及其性質，且並非僅具有「至少1個或至少4個之峰值表徵」之化合物即會落入系爭專利請求項2至3的範圍内，系爭專利請求項2至3實質上為一種特定化合物之二水合物結晶型A，故其本質上亦具有該化合物之二水合物結晶型A的固有性質如固有溶解速率等（系爭專利說明書之表23)，而此等二水合物結晶型A的固有性質亦已被系爭專利之說明書所詳盡記載，如同常見的化合物專利雖僅在其申請專利範圍記載化合物之化學名稱、結構式、分子式等結構特徵，但該發明所屬技術領域中具有通常知識者自可根據其專利說明書所記載該化合物之性質而區分出一化合物是否落入所請之範圍内，化合物之結晶物之所以進一步要求以具有其技術特徵之物理、化學特性予以界定，係為了使所請化合物之結晶物能與先前技術有所區別，而系爭專利請求項2至3已然以具有至少1個或4個選自特定數值（2θ度數）之最大值之x-射線粉末繞射之數值界定，且亦能與先前技術有所區別，自當符合明確要件；綜上所述，該發明所屬技術領域中具有通常知識者在獲得一種鹽酸鹽之結晶體時，自可根據所記載之「至少1個或至少4個之峰值表徵」以及說明書所記載之關於該化合物之二水合物結晶型A的固有性質，明確區分出該結晶體是否落入系爭專利請求項2至3的範圍内。
㈢、系爭專利請求項2、3未違反核准時專利法第26條第2項（支持要件）：
系爭專利請求項2至3所請的二水合物結晶型A為系爭專利所製備出之唯一的二水合物，其餘結晶型皆非二水合物，故從系爭專利請求項2至3所記載之化學名稱即足以與系爭專利之其他結晶型有所區別，並不可謂系爭專利請求項2至3之二水合物結晶型A無法與其他結晶型區別，況且系爭專利請求項2至3所記載之二水合物結晶型A的2θ度數與其他結晶型並不相同，亦未以「約」、「±0.2」、「±0.3」等用語界定請求項的範圍，故亦不存在原告所言之數值相同或重疊的情事。系爭專利請求項2至3以特定化合物之二水合物以及具有至少1個或至少4個之x-射線粉末繞射圖案表徵來界定所請的結晶型A，各請求項彼此間已無範圍重疊致不明確者，亦能與先前技術有明確區別，且可為說明書所支持，因此系爭專利請求項2至3符合核准時專利法第26條第2項之規定。
㈣、甲證11至13之組合不足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性：
１、甲證11至13皆未揭露系爭結晶型鹽酸鹽的二水合物之結晶型A，僅憑系爭專利說明書第49頁所記載之「而該鹽酸鹽之非結晶型自發結晶為結晶型A」實不足以認定結晶型A屬已知化合物。又系爭專利請求項2至3所請結晶型為系爭結晶型鹽酸鹽的二水合物結晶型A，然而甲證11至13皆未揭露其化合物鹽酸鹽有水合物，遑論二水合物，因此該等結晶型的分子結構已與該化合物非完全相同，亦即所請化合物之特定水合物之特定結晶型非屬於已知化合物的多晶型，仍應綜合考量「否定進步性之因素」及「肯定進步性之因素」後，確認是否能建立不具進步性之論理，始能判斷所請發明是否具有進步性，而非僅根據無法預期功效之有無即遽以認定該發明是否具有進步性。
２、由於甲證11並未揭露AMN107鹽酸鹽的二水合物之結晶型A，雖甲證12揭露AMN107/AA鹽投予老鼠後之藥物動力學及甲證13揭露以AMN107單鹽酸為 Bcr-Abl抑制劑來治療慢性骨髓性白血病，然甲證11至13均未有教示或建議將其化合物鹽酸鹽作成二水合物結晶型A，是以，該發明所屬技術領域中具有通常知識者基於甲證11至13，參酌申請時通常知識，並不會產生合理動機將其化合物鹽酸鹽作成二水合物之結晶型A而輕易完成系爭專利發明，因此甲證11至13之組合並不足以證明系爭專利請求項2至3不具進步性。
㈤、甲證11至14、17之組合不足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性：
甲證11至13雖可證明系爭專利優先權日前，AMN107鹽酸鹽已是習知化合物，且業已用於醫藥用途，惟甲證14僅概括性揭露式I化合物，包括其鹽，亦可以水合物之形式獲得其結晶可包括例如使用於結晶之溶劑，並未揭露個別化合物以鹽酸鹽水合物的形式存在，亦即甲證14僅揭露AMN107化合物，而仍未揭露AMN107鹽酸鹽水合物，故原告主張甲證14揭示包括AMN107鹽酸鹽等鹽類之化學式I可為水合物、結晶型等形式等語與事實不符，並不可採。又甲證17記載AMN107，並以括號加註NVP-AMN107-AA，所註明之文獻（12）即為甲證13，亦即甲證17係將代號AMN107與NVP-AMN107-AA混用。雖然甲證18在NVP-AMN107-AA之後加註鹽酸鹽單水合物，惟並不足以證明該NVP-AMN107-AA代號在系爭專利之優先權日前即被用以表示AMN107鹽酸鹽單水合物。在系爭專利之國際優先權日前，當該發明所屬技術領域中具有通常知識者在獲知甲證17之內容時，僅會認知甲證17揭露AMN107鹽酸鹽之使用，斷無可能認為甲證17揭露AMN107鹽酸鹽單水合物，故原告主張甲證17揭露AMN107鹽酸鹽單水合物，與事實不符。
㈥、甲證11至14、17、19之組合；甲證11至14、17、20之組合；甲證11至14、17、21之組合；甲證11至14、17與甲證19至21之組合，均不足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性：
１、甲證19僅概括性揭露鹵化物相較於羧酸鹽更容易形成水合物，並未揭露與AMN107相關之化合物所形成之鹽酸鹽可為水合物。甲證20揭露藥物鹽酸鹽之結晶型水合物的備製，甲證21則揭露藥物結晶型水合物的備製，亦皆未提及其藥物為AMN107，故原告主張甲證20、21教示可將甲證11至14、17所揭示之AMN107鹽酸鹽形成水合結晶物的方式，亦不可採。
２、由於甲證14、17、19至21仍未揭露或教示AMN107鹽酸鹽的水合物，故並未補足甲證11至13所未揭露之關於將AMN107鹽酸鹽作成二水合物結晶型A的部分，所請化合物之特定水合物之特定結晶型非屬於已知化合物的多晶型，不能僅根據無法預期功效之有無即遽以認定該發明是否具有進步性。
㈦、被告答辯聲明：原告之訴駁回；訴訟費用由原告負擔。
四、參加人陳述意見略以：
㈠、系爭專利請求項2、3對應之說明書內容未違反核准時專利法第26條第1項（可據以實現要件）之規定；系爭專利請求項2、3未違反核准時專利法第26條第2項（明確要件、支持要件）之規定，均與被告答辯相同，茲不贅述。
㈡、甲證11至14、17及19至21之組合不足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性：
１、我國專利制度對於「已知化合物」之新穎結晶形式具有可專利性採肯定之態度，因多晶型的分子結構係與該化合物完全相同，僅結晶型態有所不同，且多晶型通常以例行之實驗方法即可獲得，故原則上已知化合物的多晶型不具進步性，除非該多晶型較該已知化合物具有無法預期的功效，例如TWI738269、TWI695004、TWI652012、TWI508962等。系爭專利案所請結晶型所涉之化合物並非「已知化合物」，系爭專利請求項2、3所請結晶型A係AMN107鹽酸鹽之「二水合物」，就分子結構而論，系爭專利所請結晶型包括AMN107鹽酸鹽的二水合物(結晶型A)以及單水合物(結晶型B)及其他水合物/溶劑合物，因此該等結晶型之分子結構已與該化合物非完全相同。再者，系爭專利所請結晶型並非以例行之實驗方法所獲得。即結晶型A必須先將AMN107鹽酸鹽在特定溫度下溶解於特定溶劑中，再經過加熱、冷卻等步驟方能獲得者，而系爭專利結晶型B又係在甲醇蒸汽存在下，得以從結晶型A轉化為結晶型B（系爭專利說明書第13頁第2行參照)，其等並非審查基準所述之「例行之實驗方法」。
２、甲證14、17、19至21為新證據，其中甲證14僅概括性揭露式Ⅰ之化合物，並未揭露其鹽酸鹽，更未揭露鹽酸鹽之水合物，遑論其鹽酸鹽之二水合物及單水合物之特定結晶型。系爭專利係將特定結晶固體-AMN107游離鹼之結晶型A加入於乙酸乙酯後再添加鹽酸，然而甲證14之實施例92及實施例68係在施加乙酸乙酯後才得到未知的結晶固體，二者的起始物及步驟皆不相同，顯然不得以此遽認甲證14之實施例92及實施例68所製得之AMN107游離鹼即為結晶型A及B，亦即甲證14僅揭露AMN107化合物，而仍未揭露結晶型A及B，遑論結晶型A及B之AMN107鹽酸鹽，故原告主張系爭專利所請之結晶型A(即系爭專利請求項2及3)基於甲證14及通常知識之揭示可輕易完成云云與事實不符，並不可採。又查甲證17記載AMN107，即甲證17係將代號AMN107與NVP-AMN107-AA混用，且從甲證17僅可得知其所使用者為AMN107鹽酸鹽。甲證19僅概括性揭露鹵化物相較於羧酸鹽更容易形成水合物，惟並未揭露或教示任何與AMN107相關之化合物所形成之鹽酸鹽可為水合物。另外，甲證20揭露藥物鹽酸鹽之結晶型水合物的製備，甲證21則揭露了藥物結晶型水合物的製備，皆未具體提及其藥物為AMN107，因此，甲證19至21所揭露者仍無關於系爭專利所請AMN107之鹽酸鹽、水合物及其結晶型等。因此甲證11、12、13、14、17或其任意組合，或甲證11、12、13、14及/或17與甲證19、20及/或21之組合並不足以證明系爭專利請求項2至3不具進步性。
３、綜上，由原告所援引之甲證11至14、17及19至21觀之，並無任一證據揭示AMN107鹽酸鹽之結晶型，遑論揭露其製備方法，因此在沒有任何證據揭露AMN107鹽酸鹽之結晶型的情況下，若稱系爭專利所請結晶型可由「例行之實驗方法」所獲得而欲適用核准時專利審查基準第二篇第十三章第5.3.1.3節中多晶型進步性的判斷標準，顯失公允。
㈢、參加人答辯聲明：原告之訴駁回；訴訟費用由原告負擔。
五、本件爭點（本院卷二第319頁）：
㈠、系爭專利請求項2、3對應之說明書內容是否違反核准時專利法第26條第1項（可據以實現要件）之規定？
㈡、系爭專利請求項2、3是否違反核准時專利法第26條第2項（明確要件）？
㈢、系爭專利請求項2、3是否違反核准時專利法第26條第2項（支持要件）？
㈣、甲證11至13之組合是否足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性？
㈤、甲證11至14、17之組合是否足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性？
㈥、甲證11至14、17、19之組合是否足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性？
㈦、甲證11至14、17、20之組合是否足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性？
㈧、甲證11至14、17、21之組合是否足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性？
㈨、甲證11至14、17與甲證19、20、21之組合是否足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性？
六、本院之判斷：
㈠、本件應適用之專利法：系爭專利申請日為95年7月19日，核准審定日為102年5月6日，其是否有應撤銷專利權之情事，應以核准審定時所適用之100年12月21日修正公布、102年1月1日施行之專利法為斷。
按利用自然法則之技術思想之創作，而可供產業上利用者，得依法申請取得發明專利，核准時專利法第21條及第22條第1項前段定有明文，又說明書應明確且充分揭露，使該發明所屬技術領域中具有通常知識者，能瞭解其內容，並可據以實現。各請求項應以明確、簡潔之方式記載，且必須為說明書所支持。發明為其所屬技術領域中具有通常知識者依申請前之先前技術所能輕易完成時，不得取得發明專利，核准時專利法第26條第1項、第2項後段、第22條第2項後段亦有明文。
㈡、本院得審酌新證據：按「關於撤銷、廢止商標註冊或撤銷專利權之行政訴訟中，當事人於言詞辯論終結前，就同一撤銷或廢止理由提出之新證據，智慧財產及商業法院仍應審酌之」，智慧財產案件審理法（下稱審理法）第33條第1項定有明文，其立法目的是為了避免舉發人就之前行政訴訟中未能提出之新證據，就同一專利權或商標權「再為舉發」，或「再為異議、評定、廢止」，而衍生另一行政爭訟程序（審理法第33條第1項立法理由參照）。由此可知，依審理法第33條提出「新證據」之人，於專利行政訴訟中必為得提起舉發之人，於商標行政訴訟中必為得提起異議、評定、廢止之人，專利權人或商標權人不會提出撤銷自己專利權或商標權之「新證據」，本件原告（即舉發人）於舉發階段以「甲證11至13之組合」證明系爭專利不具進步性，復於行政訴訟中提出甲證14、17、19、20至21（為獨立證據非輔助證據或補強證據），再主張以「甲證11至14、17之組合」、「甲證11至14、17、19之組合」、「甲證11至14、17、20之組合」、「甲證11至14、17、21之組合」、「甲證11至14、17與甲證19、20、21之組合」，證明系爭專利請求項2、3不具進步性，則本件「新證據」即為上述之組合，本院應予審酌。
㈢、系爭專利技術分析：
１、系爭專利技術內容：本發明係關於4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－
5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺游離鹼之大體上純淨之結晶型。本發明亦係關於4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺之鹽酸鹽及硫酸鹽之大體上純淨之結晶型。本發明進一步關於一種醫藥組合物，其包含：(a) 治療有效量之本發明4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺游離鹼或其鹽之大體上純淨之結晶型；及(b) 至少一醫藥上可接受之載劑、稀釋劑、媒劑或賦形劑。本發明亦係關於一種治療對蛋白激酶活性之抑制起反應之疾病的方法，該方法包括向有此治療需要之受試者投與治療有效量之本發明4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺游離鹼或其鹽之大體上純淨之結晶型的步驟（系爭專利說明書第8頁第15行至第9頁第8行，本院卷一第86至87頁）。
２、系爭專利申請專利範圍分析：系爭專利申請專利範圍係為參加人於109年8月3日提出更正，經被告審定准予更正，業如前述，系爭專利申請專利範圍共有11項，原告所爭執之請求項2、3，及請求項2涉及之請求項1（業經刪除），分別列載如下：
⑴、請求項1（刪除）：一種4-甲基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）
-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺鹽酸鹽之大體上純淨之結晶型A，由具有至少1個選自
8.5°、11.0°、11.5°、17.2°、18.8°、19.2°、20.8°、22.1°及26.0°（2θ度數）之最大值之x-射線粉末繞射圖案表徵；其中「大體上純淨」係指大於50%結晶4-甲基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺鹽酸鹽呈現於所述之結晶型中。
⑵、請求項2：如請求項1之大體上純淨之結晶型，其中結晶型A係二水合物。
⑶、請求項3：如請求項2之大體上純淨之結晶型，其中該大體上
純淨之結晶型由具有至少4個選自8.5°、11.0°、11.5°、17.2°、18.8°、19.2°、20.8°、22.1°及26.0°（2θ度數）之最大值之x-射線粉末繞射圖案表徵。
３、系爭專利主要圖式：
⑴、主要化學式：
⑵、圖2：顯示本發明4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟
甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽之結晶型A的x－射線粉末繞射圖案(XRPD)。
㈣、舉發證據技術分析：
１、甲證11：
⑴、西元2005年5月6日公開第WO2005/039586A1號專利案，其公告
日期早於系爭專利優先權日西元2005年7月20日及西元2005年9月12日，可為系爭專利之先前技術。
⑵、甲證11說明書第6頁第1段揭露一種式I 之化合物，其為4-甲
基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺。
２、甲證12：
⑴、Weisberg等作者發表於Cancer Cell期刊,2005 Feb;7,129-14
1題目為Characterization of AMN107,a selective inhibi
tor of native and mutant Bcr-Abl文獻，其公開日期早於系爭專利優先權日西元2005年7月20日及西元2005年9月12日，可為系爭專利之先前技術。
⑵、甲證12第130頁圖1A揭露一種化合物AMN107，即為甲證11之式
I化合物，第134頁之圖4B及第135頁表2進一步揭露AMN107-AA(即AMN107之鹽酸鹽AMN107-HC1 ) 的藥物動力學數據。
３、甲證13：
⑴、Golemovic等作者發表於Clin Cancer Res.5 2005 Jul 1，l
l (13):4941-7 題目為「AMN107，a novel aminopyrimidin
e inhibitor of Bcr-Abl, has in vitro activity agains
t imatinib-resistant chronic Myeloid leukemia」之文獻，早於系爭專利優先權日西元2005年7月20日及西元2005年9月12日，可為系爭專利之先前技術。
⑵、甲證13標題揭露AMN107可用於治療對imatinib有阻抗性之慢
性骨髓性白血病，其第4942頁右欄第3段進一步揭露所使用之AMN107為AMN107單鹽酸鹽。
４、甲證14：
⑴、西元2004年1月15日公開第WO2004/005281A1號專利案，其公
開日期早於系爭專利優先權日西元2005年7月20日及西元2005年9月12日，可為系爭專利之先前技術。
⑵、甲證14第63頁實施例92揭露實施例69（為實施例68之誤繕）
之『4-Methyl-3-[[4-(3-Pyridinyl)-2-pyrimidinyl]amino]-N-[[3-[(1-hydroxy-1-methyl-ethyl)]-5-(1,1,1-trifluoromethy)phenyl]methyl]benzamide』化合物藉以製備為『4-Methyl-3-[[4-(3-Pyridinyl)-2-pyrimidinyl]amino]-N-[5-[(4-methyl-1H-imidazol-1-yl)-3-(trifluoromethyl)phenyl] benzamide』，此即為AMN107化合物。
５、甲證17：
⑴、O’Hare等作者發表於Cryst Eng Comm,11 May 2005;7(55):34
2-45之題目為「In vitro Activity of Bcr-Abl Inhibitor
s AMN107 and BMS-354825 against Clinically RelevantImatinib-Resistant Abl Kinase Domain Mutants」文獻，其公開日期早於系爭專利優先權日西元2005年7月20日及西元2005年9月12日，可為系爭專利之先前技術。
⑵、甲證17第4501頁圖1A揭露AMN107化合物結構，詳如下圖。
６、甲證19：
⑴、Hynes等作者發表於Cancer,1 June 2005;65(ll):4500-5之題
目為「Hydrate formation in NH+containing salts of pharmaceutically acceptable anions: A CSD survey」文獻，其公開日期早於系爭專利優先權日西元2005年7月20日及西元2005年9月12日，可為系爭專利之先前技術。
⑵、甲證19第1頁揭露特定機團鹽類形成水合物之分析，且第129
頁右欄第1至2行揭露「基於陰離子之研究，鹵化物（halides）相較於羧酸鹽（carboxylate）更容易形成水合物」。
７、甲證20：
⑴、Wermuth及Stahl兩作者發表於Handbook of Pharmaceutical
Salts: Properties, Selection,and Use 2002,Chapter 11,131-145之題目為「Selected Procedures for the Preparation of Pharmaceutically Acceptable Salts」文獻，其公開日期早於系爭專利優先權日西元2005年7月20日及西元2005年9月12日，可為系爭專利之先前技術。
⑵、甲證20第132頁揭露「鹽酸於其他時間當化學計量之水存在下會與之形成水合物結晶」。
８、甲證21：
１、Byrn等作者發表於Pharmaceutical Research,1995：12（7）：945-54之題目為「Pharmaceutical Solids:A StrategicApproach to Regulatory Considerations」文獻，其公開日期早於系爭專利優先權日西元2005年7月20日及西元2005年9月12日，可為系爭專利之先前技術。
２、甲證21第147頁第22至24行揭露「當水分子合併於藥物原料之晶格時即會形成水合物」，倒數第1至4行揭露「因為藥物製造過程或藥物原料之儲存或藥物劑型之關係，故研究藥物原料是否有多晶型或水合物之存在是明智的」。
㈤、爭點分析：
１、系爭專利請求項2、3對應之說明書內容違反核准時專利法第26條第1項（可據以實現要件）之規定：
⑴、查核准時之專利審查基準第二篇發明專利實體審查第一章說
明書、申請專利範圍、摘要及圖式1.3.1可據以實現記載「專利法第26條第1項規定『使該發明所屬技術領域中具有通常知識者，能瞭解其內容，並可據以實現』，指說明書應明確且充分記載申請專利之發明，記載之用語亦應明確，使該發明所屬技術領域中具有通常知識者，在說明書、申請專利範圍及圖式三者整體之基礎上，參酌申請時之通常知識，無須過度實驗，即能瞭解其內容，據以製造及使用申請專利之發明，解決問題，並且產生預期的功效」等內容。
⑵、系爭專利請求項2依附於請求項1，雖系爭專利請求項1業已刪
除，惟系爭專利請求項2於解釋上仍包含系爭專利請求項1之全部技術特徵，系爭專利請求項3係依附於系爭專利請求項2，系爭專利請求項3於解釋上仍包含系爭專利請求項2之全部技術特徵，系爭專利請求項2之範圍應為：一種4-甲基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺鹽酸鹽「二水合物」之大體上純淨之結晶型A，由具有「至少1個」選自8.5°、11.0°、1
1.5°、17.2°、18.8°、19.2°、20.8°、22.1°及26.0°（2θ度數）之最大值之x-射線粉末繞射圖案表徵；其中「大體上純淨」係指大於50%結晶4-甲基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺鹽酸鹽「二水合物」呈現於所述之結晶型中；而系爭專利請求項3之範圍應為：一種4-甲基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺鹽酸鹽「二水合物」之大體上純淨之結晶型A，由具有「至少4個」選自8.5°、11.0°、11.5°、17.2°、18.8°、19.2°、20.8°、22.1°及26.0°（2θ度數）之最大值之x-射線粉末繞射圖案表徵；其中「大體上純淨」係指大於50%結晶4-甲基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺鹽酸鹽「二水合物」呈現於所述之結晶型中。
⑶、又系爭專利說明書第12頁倒數第4行至第13頁第14行記載「本
發明其他實施例係關於4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺之所述鹽之該等大體上純淨之結晶型中的每一個。該鹽酸鹽之結晶型A係具有相對較差結晶度之二水合物。……該鹽酸鹽之結晶型A之x－射線粉末繞射圖案顯示有至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且最佳全部選自約8.5°、11.0°、11.5°、17.2°、18.8°、19.2°、20.8°、22.1°及26.0°(2θ度數)之最大值。本發明一尤佳實施例係關於藉由圖2之XRPD表徵之4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽之大體上純淨之結晶型A」，第14頁第16至18行揭露「與該鹽酸鹽之結晶型A相關之其他結晶型包括結晶型A'及結晶型A"，其分別表示結晶型A之單水合物及結晶型A之無水形式」。
⑷、次查，系爭專利說明書第49頁第3至11行揭露「亦進一步對4－
甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽之結晶型A、結晶型B、結晶型C及非結晶型之全部實施穩定性研究。對於結晶型A、B及C，在不同相對濕度下貯存後未觀察到形式轉變；而該鹽酸鹽之非結晶型自發結晶為結晶型A。此外，每一結晶型皆具有良好的化學穩定性，50℃時保持1個月，80℃時保持1個月且在80℃及75%相對濕度下保持1個月，但結晶型C及非結晶型二者在上述最後一種條件下顯示為與結晶型A之混合物」，就該發明所屬技術領域中具有通常知識者可理解「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽二水合物之結晶型A」可於高相對濕度及不同高溫下（如：50℃）下具有儲存安定性，不會轉變為其他結晶型；又查系爭專利說明書實例10，其中表10所列溶劑乙醇、乙酸乙酯及乙腈，均可產生結晶型A及B之混合晶型狀態，實施例27揭露將約100毫克4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽之結晶型B在60℃下溶於約2毫升甲醇/水（99.0/1.0）中（參見表16），24小時後可測得具有結晶型SB及SC（混合晶型狀態），該發明所屬技術領域中具有通常知識者可理解「混合晶型狀態」，特別是結晶型A可與其他晶型呈混合晶型狀態，端視不同結晶步驟而定。
⑸、就系爭專利請求項2而言，所申請者即為「一種4-甲基-N-[3-
（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺鹽酸鹽二水合物之大體上純淨之結晶型A」，係以具有至少1個選自8.5°、11.0°、11.5°、17.2°、18.8°、19.2°、20.8°、22.1°及26.0°（2θ度數）之最大值之x-射線粉末繞射圖案表徵加以界定，查系爭專利說明書第15頁第3至7行揭露「結晶型A"」之XRPD最大值為「至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且最佳全部選自約4.5°、8.8°、11.5°、11.9°、13.0°、14.4°、14.8°、15.3°、16.9°、17.6°、19.2°、19.5°、19.9°、21.3°、2
4.6°、25.4°、26.4°、27.9°及31.5°(2θ度數) 之最大值」，而第15頁倒數第1至5行揭露「結晶型B」之XRPD最大值為「至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且最佳全部選自約7.2°、9.2°、11.4°、12.0°、12.3°、14.6°、14.8°、15.7°、17.6°、19.2°、19.5°、20.5°、22.0°、23.4°、
23.9°、25.0°、25.5°、25.9°、27.0°(2θ度數)之最大值」，另第17頁第5至9行揭露「結晶型B'」之XRPD最大值為「至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且最佳全部選自約7.2°、9.2°、11.5°、12.0°、13.9°、14.3°、15.4°、1
7.6°、18.6°、20.3°、21.7°、22.5°、23.2°、24.7°、24.9°、25.2°、26.0°、26.6°、27.5°、28.2°、29.2°及30.0°(2θ度數) 之最大值」，第18頁第4至6行揭露「結晶型SB」之XRPD最大值為「至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且最佳全部選自約7.5°、9.3°、11.5°、14.8°、19.4°、2
1.9°、23.0°、23.8°、24.9°、25.6°、25.9°、26.3°及26.7°(2θ度數) 之最大值」，第18頁第11至15行揭露「結晶型SB'」之XRPD最大值為「至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且最佳全部選自約7.5°、9.3°、11.6°、12.4°、1
3.4°、13.8°、14.9°、19.7°、20.2°、22.0°、23.0°、23.9°、24.2°、25.1°、26.0°、26.8°、29.3°及30.7°(2θ度數)之最大值」，第19頁第2至5行揭露「結晶型C」之XRPD最大值為「至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且最佳全部選自約6.6°、7.0°、8.9°、11.2°、11.8°、13.3°、1
4.0°、17.3°、18.4°、20.0°、22.1°及23.0°(2θ度數) 之最大值」，第21頁倒數第1至4行揭露「結晶型SE」之XRPD最大值為「至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且最佳全部選自約3.4°、4.5°、5.1°、5.8°、7.2°、9.3°、10.1°、12.9°、13.3°、13.8°、14.8°、15.7°、17.4°、19.6°、
20.8°、21.3°、22.5°、24.4°、25.5°、26.0°、27.4°及27.9°(2θ度數) 之最大值」，是以，該發明所屬技術領域中具有通常知識者可理解結晶型A"、結晶型B、結晶型B'、結晶型SB、結晶型SB'、結晶型C及結晶型SE均有1或2個XRPD最大值與結晶型A相同（如：11.5°、19.2°、20.8°、22.1°及26.0°），若結晶型A僅以11.5°、19.2°、20.8°、22.1°及26.0°之「任1個」，甚至「任2個」XRPD最大值加以界定，則可能顯示該結晶型中可能混有與結晶型A之1或2個XRPD最大值相同之其他結晶型，如請求項2係以1個19.2°XRPD最大值界定結晶型A，則結晶型B之XRPD最大值亦同有19.2°，即會產生該結晶型A是否混合有結晶型B之可能態樣（因系爭專利請求項2有界定大體上純淨之結晶型A，係為該結晶型中大於50％結晶型A，其他成分除包含雜質外，解釋上應不排除混有其他晶型可能性），查系爭專利說明書並未揭露在僅有1個或2個相同XRPD最大值之界定下，需以何種技術手段判斷結晶型A含量百分比大於50％（相對於結晶型A"、結晶型B、結晶型B'、結晶型SB、結晶型SB'、結晶型C及結晶型SE），是以，系爭專利請求項2對應之說明書內容，未明確且充分揭露，無法使該發明所屬技術領域中具有通常知識者能瞭解其內容並據以實施而違反核准時專利法第26條第1項之規定。
⑹、另就系爭專利請求項3而言，所申請者即為「一種4-甲基-N-[
3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺鹽酸鹽二水合物之大體上純淨之結晶型A」，係以具有「至少4個」選自8.5°、11.0°、1
1.5°、17.2°、18.8°、19.2°、20.8°、22.1°及26.0°（2θ度數）之最大值之x-射線粉末繞射圖案表徵加以界定，且該結晶型A可穩定存在，亦無與系爭專利說明書所揭露之各種結晶型（A、A'、A"、B'、B、SB、SB'、C、C'、SC及SE）之XRPD最大值中有「4個以上」數值之相同重複，惟查系爭專利說明書第14頁第19至23行揭露「該鹽酸鹽之結晶型A'(單水合物)之x-射線粉末繞射圖案顯示有至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且更佳全部選自『約』4.3°、8.6°、1
1.6°、12.1°、17.1°、20.6°、24.5°、25.3°、25.8°、27.3°及31.6°(2θ度數) 之最大值」，第15頁第2至7行揭露「該鹽酸鹽之結晶型A"(無水)之x-射線粉末繞射圖案顯示至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且更佳全部選自『約』4.5°、8.8°、11.5°、11.9°、13.0°、14.4°、14.8°、15.3°、16.9°、17.6°、19.2°、19.5°、19.9°、21.3°、24.6°、25.4°、26.4°、27.9°及31.5°(2θ度數) 之最大值」，第15頁倒數第1至5行揭露「該鹽酸鹽之結晶型B之x-射線粉末繞射圖案顯示至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且更佳全部選自『約』7.2°、9.2°、11.4°、12.0°、12.3°、1
4.6°、14.8°、15.7°、17.6°、19.2°、19.5°、20.5°、22.0°、23.4°、23.9°、25.0°、25.5°、25.9°、27.0°(2θ度數)之最大值」，第18頁第4至6行揭露「該鹽酸鹽之結晶型SB之x-射線粉末繞射圖案顯示至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且更佳全部選自『約』7.5°、9.3°、11.5°、14.8°、19.4°、21.9°、23.0°、23.8°、24.9°、25.6°、25.9°、
26.3°及26.7°(2θ度數) 之最大值」，第19頁第2至5行揭露「該鹽酸鹽之結晶型C之x-射線粉末繞射圖案顯示至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且更佳全部選自『約』6.6°、7.0°、8.9°、11.2°、11.8°、13.3°、14.0°、17.3°、1
8.4°、20.0°、22.1°及23.0°(2θ度數) 之最大值」，第20頁倒數第3行至第21頁第2行揭露「該鹽酸鹽之結晶型SC之x-射線粉末繞射圖案顯示至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且更佳全部選自『約』6.5°、7.3°、9.1°、10.8°、12.1°、13.0°、14.5°、14.9°、18.9°、19.4°、24.2°、25.0°、25.4°、26.2°、27.4°及28.4°(2θ度數) 之最大值」，再查，系爭專利說明書第10頁第2至4行揭露「關於XRPD最大值(以°表示)之詞語『約』通常係指在給定值之0.3°以內，更佳0.2°以內，且最佳0.1°以內。或者，當為熟習此項技術之通常知識者所考慮時，詞語『約』(在此處及全文中)係指在可接受之平均值標準誤差內」，故考量「±0.2」、「±0.3」之誤差值範圍，上開結晶型A'、結晶型A"、結晶型B、結晶型SB、結晶型C、結晶型SC之XRPD最大值「至少有4個數值」會涵蓋結晶型A之至少有4個XRPD最大值（參下表），故若僅以至少4個「落入」上開結晶型A'、結晶型A"、 結晶型B、結晶型SB、結晶型C、結晶型SC之XRPD最大值誤差範圍之數值界定結晶型A（如：8.5°、11.0°、11.5°、17.2°、19.2°、20.8°、22.1°等），即有可能為結晶型A混合有其他與結晶型A至少4個XRPD最大值落入誤差範圍之晶型(如：結晶型A')之態樣，同前所述，系爭專利說明書未揭露結晶型A之XRPD最大值與結晶型A'、結晶型A"、結晶型B、結晶型SB、結晶型C、結晶型SC之XRPD最大值誤差範圍至少有4個數值範圍重複下，需以何種技術手段判斷結晶型A含量百分比大於50％（相對於結晶型A'、結晶型A"、結晶型B、結晶型SB、結晶型C、結晶型SC），是以，系爭專利請求項3對應系爭專利說明書內容，未明確且充分揭露，無法使該發明所屬技術領域中具有通常知識者能瞭解其內容並據以實施，而違反核准時專利法第26條第1項之規定。
結晶型A之XRPD最大值 8.5°、11.0°、11.5°、17.2°、18.8°、19.2°、20.8°、22.1°及26.0° 結晶型A'之XRPD最大值 4.3°、8.6°、11.6°、12.1°、17.1°、20.6°、24.5°、25.3°、25.8°、27.3°及31.6° 在「±0.2」、「±0.3」之誤差值範圍與結晶型A之XRPD最大值重疊之值 8.6°、11.6°、17.1°、20.6°、25.8° 結晶型A"之XRPD最大值 4.5°、8.8°、11.5°、11.9°、13.0°、14.4°、14.8°、15.3°、16.9°、17.6°、19.2°、19.5°、19.9°、21.3°、24.6°、25.4°、26.4°、27.9°及31.5° 在「±0.2」、「±0.3」之誤差值範圍與結晶型A之XRPD最大值重疊之值 8.8°、11.5°、16.9°、19.2° 結晶型B之XRPD最大值 7.2°、9.2°、11.4°、12.0°、12.3°、14.6°、14.8°、15.7°、17.6°、19.2°、19.5°、20.5°、22.0°、23.4°、23.9°、25.0°、25.5°、25.9°、27.0° 在「±0.2」、「±0.3」之誤差值範圍與結晶型A之XRPD最大值重疊之值 11.4°、19.2°、19.5°、20.5°、22.0°、25.9° 結晶型SB之XRPD最大值 7.5°、9.3°、11.5°、14.8°、19.4°、21.9°、23.0°、23.8°、24.9°、25.6°、25.9°、26.3°及26.7° 在「±0.2」、「±0.3」之誤差值範圍與結晶型A之XRPD最大值重疊之值 11.5°、19.4°、21.9°、25.9° 結晶型C之XRPD最大值 6.6°、7.0°、8.9°、11.2°、11.8°、13.3°、14.0°、17.3°、18.4°、20.0°、22.1°及23.0° 在「±0.2」、「±0.3」之誤差值範圍與結晶型A之XRPD最大值重疊之值 11.2°、11.8°、17.3°、22.1° 結晶型SC之XRPD最大值 6.5°、7.3°、9.1°、10.8°、12.1°、13.0°、14.5°、14.9°、18.9°、19.4°、24.2°、25.0°、25.4°、26.2°、27.4°及 28.4° 在「±0.2」、「±0.3」之誤差值範圍與結晶型A之XRPD最大值重疊之值 10.8°、18.9°、19.4°、26.2°
⑺、參加人雖謂系爭專利之請求項所載「大體上純淨」之結晶型
，主要形成結晶體時，可能會有些雜質存在於結晶體內，因此有各種有關結晶體內雜質的研究，而本領域通常知識可以高效能液相層析法（High Performance Liquid Chromatography，HPLC）測量純度，如系爭專利說明書表21等云云，惟查該發明所屬技術領域中具有通常知識者可理解系爭專利說明書表21所揭露之HPLC純度（面積％）係以高效能液相層析法測量其結晶型之純度（若有雜質或不純物可於HPLC圖譜中以其與待測主成分不同滯留時間之波峰顯示，可與待測主成分區隔），且待分析物係以溶解於溶液之形式進行分析，其結晶型態於溶液形式中已不復存在，故對於前開混合晶型之態樣，是否可為高效能液相層析法所鑑別已然超出申請時通常知識之範圍，更未記載高效能液相層析法於混合晶型態樣下可鑑別結晶型A大於50％之步驟，亦未揭露其實施例佐證，是以該發明所屬技術領域中具有通常知識者參酌系爭專利說明書表21僅能理解該高效能液相層析法可應用於結晶型純度分析，尚無法理解對於前開混合晶型之態樣下，如何鑑別結晶型A且該結晶型A大於50％，系爭專利說明書當有前開未明確且充分揭露，無法使該發明所屬技術領域中具有通常知識者能瞭解其內容並據以實施之問題。
⑻、原告雖於舉發理由稱「系爭專利並未說明如何取得製備各晶
型所需之起始物，即4-甲基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺之鹽酸鹽或游離鹼或提供該鹽酸鹽或游離驗之製備方法」云云。惟查，系爭專利說明書第7頁第5至8行記載「下式之化合物4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺係闡述於WO
2004/005281 A1之實例92中」，是以，該發明所屬技術領域中具有通常知識者可獲致4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺可以被製備，由於一個醫藥化合物鹽類之形成，本即屬於酸鹼中和反應，故當4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺溶於進行反應之溶劑時，即成為鹼性離子化合物，此即為游離鹼形式，尚難謂系爭專利說明書未揭露4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺之游離鹼及製備方法；又系爭專利說明書實例23記載「將4.0克4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺游離鹼在50℃下溶於60毫升甲醇中。以存於2毫升甲醇之溶液形式添加1.05當量(688.7微升)氫氯酸。使該溶液在50℃下靜置60分鐘。使該溶液冷卻至42℃且在此溫度下保持15分鐘。添加存於甲醇(40毫克)/水(0.4毫克)中且在超聲波浴中均質化10秒之4毫克4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽懸浮液」，即已揭露以4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺游離鹼形式經酸鹼中和反應形成鹽酸鹽，亦難謂系爭專利說明書未揭露4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺之鹽酸鹽及製備方法。
⑼、是以，系爭專利請求項2、3所對應系爭專利說明書部分，並
未明確且充分揭露，無法使該發明所屬技術領域中具有通常知識者能瞭解其內容，並據以實施，固有違反核准時專利法第26條第1項之規定。
２、系爭專利請求項2、3違反核准時專利法第26條第2項（明確要件）：
⑴、查核准時之專利審查基準第二篇發明專利實體審查第一章說
明書、申請專利範圍、摘要及圖式2.4.1明確記載「請求項應明確，指每一請求項之記載應明確，且所有請求項整體之記載亦應明確，使該發明所屬技術領域中具有通常知識者，單獨由請求項之記載內容，即可明確瞭解其意義，而對其範圍不會產生疑義。具體而言，即每一請求項中記載之範疇及必要技術特徵應明確，且每一請求項之間的依附關係亦應明確。解釋請求項時得參酌說明書、圖式及申請時之通常知識」，2.4.1.2說明書與請求項不一致記載「說明書與請求項之記載不一致，而可能使請求項不明確。例如依『說明書之記載』，並參酌申請時之通常知識，認定獨立項未敘明必要技術特徵，而導致請求項不明確。此外，審查時若認為獨立項未敘明必要技術特徵，亦可能導致請求項無法為說明書所支持，或導致申請專利之發明違反可據以實現要件」。又核准時專利審查基準第二篇發明專利實體審查第十三章醫藥相關發明4.2.1.1化合物請求項記載「……申請專利之發明為化合物之結晶物時，原則上，請求項應以具有其技術特徵之物理、化學特性，例如X射線粉末繞射、X射線單晶繞射、IR、Raman、NMR 等光譜分析法、或DTA、TGA、DSC 等熱分析方法之數值界定其『晶體結構』，使該發明所屬技術領域中具有通常知識者足以認定申請專利之發明與先前技術之區別。請求項撰寫為『一種化合物 X之多晶型』，因所述之多晶型A型是任意的名稱，並無技術特徵之描述，是不明確的」，故就本案而言，結晶型A僅是一任意名稱，該發明所屬技術領域中具有通常知識者可理解當請求項之發明為化合物結晶型，則必須特別以「X 射線粉末繞射」分析法所得之數值加以界定，即晶體結構之特性係由前開分析數值所賦予，故系爭專利請求項2或3所請一種4-甲基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺鹽酸鹽二水合物之大體上純淨之結晶型A，所請該晶體結構特徵係由所記載之x-射線粉末繞射圖案（2θ度數）之最大值加以界定。
⑵、原告主張中國藥典有關粉末X射線衍射法（即XRPD)章節記載
：「晶態物質的粉末X射線衍射峰是由數十乃至上百個銳峰（窄峰）組成;而非晶態物質的粉末X射線衍射峰的數量較少且呈瀰散狀（為寬峰或饅頭峰）」（參甲證7第56頁右欄之「第二法」一節）之說明可知，不管是結晶型或非結晶型物質，其XRPD均具有峰值，而結晶型應至少具有數十個峰值，方可有別於仍具有少量峰值之非結晶型，歐洲藥典中，於有關XRPD之晶體特性章節（甲證6之第383頁左欄倒數第二段）亦明確記載：「It is generally sufficient to scanpast the 10 strongest reflections identified in singlephase XRPD database files」，美國藥典亦出現同樣内容於甲證5第431頁左欄第一段，可證藉由XRPD定性結晶類型，通常須包含十個（2θ度數）最大值來作為x-射線粉末繞射圖案表徵，方足以使該領域具有通常知識者判定其結晶型云云，惟查關於上開中國藥典、歐洲藥典及美國藥典均是針對藥物成分之研究分析為出發點，當一藥物成分結晶型態是以X射線粉末繞射（XRPD）之方式分析時，所呈現之數十個峰值，均是代表此化合物結晶型晶體結構之特性，就藥物成分開發之立場，自當將該特性盡量揭露並瞭解，是以，若測出有多少個窄峰峰值，自應將其盡量全部揭露，然核准時專利法第26條第2項之明確要件，卻與藥物成分開發之精神不同，上開醫藥相關發明審查基準相關規定內容，X射線粉末繞射（XRPD）之峰值之界定係為與先前技術有所區分，或上開專利審查基準明確要件規定內容，依據說明書之記載，參酌申請時之通常知識，考量請求項之結晶型發明是否記載必要技術特徵，可以X射線粉末繞射（XRPD）之峰值加以界定其化合物結晶型，惟均未明確規定須以多少個X射線粉末繞射之測定峰值藉以界定化合物結晶型特徵方屬明確，故只要該X射線粉末繞射之測定峰值之界定足以與先前技術有所區隔，或已記載足夠之必要技術特徵，單就系爭專利請求項2中界定最少1個，系爭專利請求項3中界定最少4個（2θ度數）最大值來作為x-射線粉末繞射圖案表徵，尚難謂不明確，惟本案系爭專利請求項2及3，該發明所屬技術領域中具有通常知識者參考系爭專利說明書確有未記載必要技術特徵之問題（詳後述），而有記載不明確之態樣。
⑶、承上，然就系爭專利請求項2而言，若以「1個」選自8.5°、1
1.0°、11.5°、17.2°、18.8°、19.2°、20.8°、22.1°及26.0°（2θ度數）之最大值之x-射線粉末繞射圖案表徵，如：「1
1.5°」，加以界定「4-甲基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺鹽酸鹽二水合物之大體上純淨之結晶型A」之「晶體結構」，即可能會與結晶型A"、結晶型B'及結晶型SB之XRPD最大值之一（11.5°）所界定者相同，然所請之結晶型A的晶體結構係由XRPD最大值所界定賦予，結晶型A僅為一「任意名稱」，進而造成該發明所屬技術領域中具有通常知識者無法判讀系爭專利請求項2之發明究係「大體上純淨之結晶型A」，還是「大體上純淨之結晶型A"」、「大體上純淨之結晶型B'」、「大體上純淨之結晶型SB」（承上述，系爭專利說明書均明確記載有可以至少1個XRPD最大值界定結晶型A"、B'、SB），有未記載必要技術特徵，而記載不明確之情形，故系爭專利請求項2違反核准時專利法第26條第2項之規定。另就系爭專利請求項3而言，若以「4個以上」選自8.5°、11.0°、11.5°、17.2°、18.8°、19.2°、20.8°、22.1°及26.0°（2θ度數）之最大值之x-射線粉末繞射圖案表徵，雖與系爭專利說明書所揭露之各種結晶型（A、A'、A"、B、B'、SB、SB'、C、C'、SC及SE）之（2θ度數）最大值之x-射線粉末繞射圖案表徵不具有4個以上數值相同，惟查系爭專利說明書第14頁第19至22行揭露「該鹽酸鹽之結晶型A'(單水合物)之x-射線粉末繞射圖案顯示有至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且更佳全部選自『約』4.3°、8.6°、11.6°、12.1°、17.1°、20.6°、24.5°、25.3°、25.8°、27.3°及31.6°」，第15頁第2至6行揭露「該鹽酸鹽之結晶型A"(無水)之x-射線粉末繞射圖案顯示至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且更佳全部選自『約』4.5°、8.8°、11.5°、11.9°、1
3.0°、14.4°、14.8°、15.3°、16.9°、17.6°、19.2°、19.5°、19.9°、21.3°、24.6°、25.4°、26.4°、27.9°及31.5°」，第15頁倒數第1至5行揭露「該鹽酸鹽之結晶型B之x-射線粉末繞射圖案顯示至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且更佳全部選自『約』7.2°、9.2°、11.4°、12.0°、12.3°、14.6°、14.8°、15.7°、17.6°、19.2°、19.5°、20.5°、22.0°、23.4°、23.9°、25.0°、25.5°、25.9°、27.0°」，第18頁第2至6行揭露「該鹽酸鹽之結晶型SB之x-射線粉末繞射圖案顯示至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且更佳全部選自『約』7.5°、9.3°、11.5°、14.8°、19.4°、21.9°、23.0°、23.8°、24.9°、25.6°、25.9°、26.3°及2
6.7°」，第19頁第2至5行揭露「該鹽酸鹽之結晶型C之x-射線粉末繞射圖案顯示至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且更佳全部選自『約』6.6°、7.0°、8.9°、11.2°、11.8°、13.3°、14.0°、17.3°、18.4°、20.0°、22.1°及23.0°」，第20頁倒數第3行至第21頁第2行揭露「該鹽酸鹽之結晶型SC之x-射線粉末繞射圖案顯示至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且更佳全部選自『約』6.5°、7.3°、9.1°、10.8°、12.1°、13.0°、14.5°、14.9°、18.9°、19.4°、2
4.2°、25.0°、25.4°、26.2°、27.4°及28.4°」，再查，系爭專利說明書第10頁第2至6行揭露「關於XRPD最大值(以°表示)之詞語『約』通常係指在給定值之0.3°以內，更佳0.2°以內，且最佳0.1°以內。或者，當為熟習此項技術之普通人員所考慮時，詞語『約』(在此處及全文中)係指在可接受之平均值標準誤差內」，故考量「±0.2」、「±0.3」之誤差值範圍，上開結晶型A'、結晶型A"、結晶型B、結晶型SB、結晶型C、結晶型SC之XRPD最大值至少有4個數值誤差範圍涵蓋結晶型A之XRPD最大值，然所請之結晶型A的晶體結構係由XRPD最大值所界定賦予，結晶型A僅為一「任意名稱」，進而造成該發明所屬技術領域中具有通常知識者無法判讀系爭專利請求項3之發明究係「大體上純淨之結晶型A」，還是「大體上純淨之結晶型A'」、「大體上純淨之結晶型A"」、「大體上純淨之結晶型B」、「大體上純淨之結晶型SB」、「大體上純淨之結晶型C」、「大體上純淨之結晶型SC」（承上述，系爭專利說明書均載有可以至少4個XRPD最大值界定結晶型A'、A"、B、SB、C、SC），有未記載必要技術特徵，而有記載不明確之情形，故系爭專利請求項3有違反核准時專利法第26條第2項之規定。
⑷、被告雖主張「並非僅具有『至少1個或至少4個之峰值表徵』之
化合物即會落入系爭專利請求項2至3的範圍內，系爭專利請求項2至3實質上為一種特定化合物之二水合物結晶型A，故其本質上亦具有該化合物之二水合物結晶型A的固有性質如固有速率等（系爭專利說明書之表23），故該發明所屬技術領域中具有通常知識者在獲得一種鹽酸鹽之結晶體時，自可根據所記載之『至少1個或至少4個之峰值表徵』以及『說明書所載之性質』，明確區分出該結晶體是否落入系爭專利請求項2至3之範圍」云云，惟按發明專利權範圍，以申請專利範圍為準，於解釋申請專利範圍時，並得審酌說明書及圖式，核准時專利法第58條第4項定有明文。是解釋申請專利範圍時，得審酌說明書及圖式，俾以瞭解該發明之目的、作用及效果，惟申請專利範圍係就說明書中所載實施方式或實施例作總括性之界定，除非說明書中已明確表示申請專利範圍之內容應限於實施例及圖式，否則不得將說明書及圖式之限制條件讀入申請專利範圍，而變更申請專利範圍對外公告而客觀表現之專利權範圍（最高行政法院109年判字第130號判決意旨參照），而關於核准時之醫藥相關發明審查基準已明確規定當請求項所請化合物為結晶物時，其對於結晶型之命名，如「一種化合物X之多晶型A型」，其多晶型A型僅為一任意名稱，其晶型結構係由X射線粉末繞射法分析方法數值界定，而系爭專利請求項2至3所請均為一種4-甲基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺鹽酸鹽二水合物之結晶型A，分別以至少1個或至少4個之x-射線粉末繞射之（2θ度數）最大值界定，故系爭專利請求項2至3所界定之範圍自有不同，若依據被告主張直接將系爭專利說明書對於結晶型A之固有性質讀入系爭專利請求項2至3一種4-甲基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺鹽酸鹽二水合物之結晶型A而賦予該結晶型A特定性質，從而主張以至少1個或至少4個之x-射線粉末繞射之（2θ度數）最大值「界定」系爭專利請求項2至3所請一種4-甲基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺鹽酸鹽二水合物之結晶型A可明確區分，未有上開記載不明確之問題，當已違反請求項禁止讀入原則，應不足採。
⑸、另參加人主張原告所論及系爭專利請求項2至3所請「結晶型A
」，該等請求項已界定4-甲基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺鹽酸鹽之「結晶型A」為「二水合物」，而其為系爭專利說明書中僅有的「二水合物」，故可輕易與其他結晶型區分，被告主張系爭專利請求項2至3所請之二水合物結晶型A為系爭專利所製備出之唯一的二水合物，其餘結晶型皆非二水合物，系爭專利請求項2至3所記載之化學名稱即足以與系爭專利之其他晶型有所區隔等云云。惟查系爭專利請求項
2、3所請係為4-甲基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺鹽酸鹽二水合物之結晶型A，其所請範圍係為一特定晶體結構，其晶體結構特徵須由x-射線粉末繞射之（2θ度數）最大值界定，不同之x-射線粉末繞射之（2θ度數）最大值方有與其他結晶型之晶體結構鑑別之效果，「二水合物」之有無，屬化合物結構上之差異，與如何區分其他結晶型無涉，退步言，如4-甲基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺「鹽酸鹽二水合物」之結晶型A與4-甲基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺「鹽酸鹽」之結晶型B'之晶體結構若皆以1個x-射線粉末繞射之（2θ度數）最大值「11.5°」界定，則會導致不同分子化合物結構，但是其晶體結構特徵相同，有違藥學相關科學原理，更證實系爭專利請求項2及3有未記載必要技術特徵，而有記載不明確之情形，故化學結構之不同與晶體結構之鑑別，分屬二事，參加人及被告之主張均不可採。
⑹、至於原告雖主張根據系爭專利說明書第12至23頁所揭露的内
容，可知系爭專利所請的鹽酸鹽至少包含結晶型A、A'、A"、B、B'、SB、SB'、C、C'、SC及SE等多種晶型種類，其中系爭專利請求項2至3所請的結晶型A之XRPD最大值，在「±0.2」、「±0.3」之誤差值範圍内，與結晶型A'、A"、B、B'、
SB、SB'、C、C'、SC、D及SE產生至少1個、甚至6個數值相同或重疊而導致無法判讀是否為結晶型A或其他晶型云云，惟查系爭專利說明書第10頁第2至6行揭露「關於XRPD最大值(以°表示)之詞語『約』通常係指在給定值之0.3°以內，更佳0.2°以內，且最佳0.1°以內。或者，當為熟習此項技術之普通知識者所考慮時，詞語『約』(在此處及全文中)係指在可接受之平均值標準誤差內」，而系爭專利請求項2至3，均無以「約」界定其XRPD最大值，於解釋系爭專利請求項2至3時，自當不能將XRPD最大值，以「±0.2」、「±0.3」之誤差值範圍作文義解釋，故原告所主張因考量誤差範圍後解釋系爭專利請求項2及3之結晶型A可能與其他晶型之XRPD最大值重疊，而導致無法判讀其結晶型是否為結晶型A，其解釋方式有誤，尚不足採。
３、系爭專利請求項2、3違反核准時專利法第26條第2項（支持要件）：
⑴、查核准時專利審查基準第二篇發明專利實體審查第13章醫藥
相關發明4.2.3為說明書所支持有「有關化合物請求項，必須考慮該申請專利範圍是否得到說明書之支持，亦即基於說明書所揭露之內容，利用例行之實驗或分析方法是否足以將說明書所載之內容延伸到請求項之範圍，或對於說明書所揭露之內容是否僅做明顯之修飾即能獲致者」之記載，而系爭專利請求項2係為一種4-甲基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺鹽酸鹽「二水合物」之大體上純淨之結晶型A，由具有「至少1個」選自8.5°、11.0°、11.5°、17.2°、18.8°、1
9.2°、20.8°、22.1°及26.0°（2θ度數）之最大值之x-射線粉末繞射圖案表徵；其中「大體上純淨」係指大於50%結晶4-甲基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺鹽酸鹽「二水合物」呈現於所述之結晶型中，若依據「1個」最大值之x-射線粉末繞射圖案表徵以界定該結晶型A之晶體結構，如選擇以11.5°x-射線粉末繞射圖案表徵最大值界定結晶型A，則可能無法與其他結晶型區隔，且所請之結晶型A的晶體結構係由XRPD最大值所界定賦予，結晶型A僅為一「任意名稱」，則實際上無法鑑別「大體上純淨結晶型A」抑或是「大體上純淨結晶型A"、結晶型B'、結晶型SB（均有11.5°x-射線粉末繞射圖案表徵最大值）」（承上述，系爭專利說明書均明確記載有可以至少1個XRPD最大值界定結晶型A"、B'、SB），進者，亦可能呈現混合晶型狀態，即「大體上純淨結晶型A」混有結晶型A"、結晶型B'、結晶型SB，已如前述，而系爭專利說明書並未揭露「單一結晶型」態樣下，如何判別所界定之結晶型，定為結晶型A，而非其他結晶型，如：結晶型A"，或「混合晶型」態樣下，確認結晶型A大於50％，故系爭專利請求項2「無法」為系爭專利說明書所支持，違反核准時專利法第26條第2項之規定。
⑵、另關於系爭專利請求項3部分，若以「4個或以上」選自8.5°
、11.0°、11.5°、17.2°、18.8°、19.2°、20.8°、22.1°及2
6.0°（2θ度數）之最大值之x-射線粉末繞射圖案表徵界定結晶型A之晶體結構，雖與系爭專利說明書所揭露之各種結晶型（A、A'、A"、B、B'、SB、SB'、C、C'、SC、D及SE）之（2θ度數）最大值之x-射線粉末繞射圖案表徵不具有4個以上相同數值，惟查系爭專利說明書第14頁第19至22行揭露「該鹽酸鹽之結晶型A'(單水合物)之x-射線粉末繞射圖案顯示有至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且更佳全部選自『約』4.3°、8.6°、11.6°、12.1°、17.1°、20.6°、24.5°、25.3°、25.8°、27.3°及31.6°」，第15頁第2至6行揭露「該鹽酸鹽之結晶型A"(無水)之x-射線粉末繞射圖案顯示至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且更佳全部選自『約』4.5°、8.8°、11.5°、11.9°、13.0°、14.4°、14.8°、15.3°、16.9°、17.6°、19.2°、19.5°、19.9°、21.3°、
24.6°、25.4°、26.4°、27.9°及31.5°」，第15頁倒數第1至5行揭露「該鹽酸鹽之結晶型B之x-射線粉末繞射圖案顯示至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且更佳全部選自『約』7.2°、9.2°、11.4°、12.0°、12.3°、14.6°、14.8°、15.7°、17.6°、19.2°、19.5°、20.5°、22.0°、23.4°、2
3.9°、25.0°、25.5°、25.9°、27.0°」，第18頁第2至6行揭露「該鹽酸鹽之結晶型SB之x-射線粉末繞射圖案顯示至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且更佳全部選自『約』7.5°、9.3°、11.5°、14.8°、19.4°、21.9°、23.0°、23.8°、24.9°、25.6°、25.9°、26.3°及26.7°」，第19頁第2至5行揭露「該鹽酸鹽之結晶型C之x-射線粉末繞射圖案顯示至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且更佳全部選自『約』6.6°、7.0°、8.9°、11.2°、11.8°、13.3°、14.0°、17.3°、18.4°、20.0°、22.1°及23.0°」，第20頁倒數第3行至第21頁第2行揭露「該鹽酸鹽之結晶型SC之x-射線粉末繞射圖案顯示至少1個、更佳至少2個、進一步更佳至少4個、且更佳全部選自『約』6.5°、7.3°、9.1°、10.8°、12.1°、
13.0°、14.5°、14.9°、18.9°、19.4°、24.2°、25.0°、25.4°、26.2°、27.4°及28.4°」，再查，系爭專利說明書第10頁第2至4行揭露「關於XRPD最大值(以°表示)之詞語『約』通常係指在給定值之0.3°以內，更佳0.2°以內，且最佳0.1°以內。或者，當為熟習此項技術之通常知識者所考慮時，詞語『約』(在此處及全文中)係指在可接受之平均值標準誤差內」，故考量「±0.2」、「±0.3」之誤差值範圍，上開結晶型A'、結晶型A"、結晶型B、結晶型SB、結晶型C、結晶型SC之XRPD最大值至少有4個數值誤差範圍涵蓋結晶型A之XRPD最大值，若依據該「4個」最大值之x-射線粉末繞射圖案表徵以界定該結晶型A，基於所請之結晶型A的晶體結構係由XRPD最大值所界定賦予，結晶型A僅為一「任意名稱」，故實際上無法鑑別「大體上純淨之結晶型A」，還是「大體上純淨之結晶型A'」、「大體上純淨之結晶型A"」、「大體上純淨之結晶型B」、「大體上純淨之結晶型SB」、「大體上純淨之結晶型C」、「大體上純淨之結晶型SC」（承上述，系爭專利說明書均載有可以至少4個XRPD最大值界定結晶型A'、A"、B、SB、C、SC），進者，亦可能呈現混合晶型狀態，即「大體上純淨結晶型A」混有結晶型A'、結晶型A"、結晶型B、結晶型SB、結晶型C、結晶型SC，已如前述，而系爭專利說明書並未揭露「單一結晶型」態樣下，如何判別所界定之結晶型，定為結晶型A，而非其他結晶型，如：結晶型A"，或「混合晶型」態樣下，確認結晶型A大於50％，故系爭專利請求項3無法為系爭專利說明書所支持，而有違反核准時專利法第26條第2項之規定。
４、甲證11至13之組合不足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性：
⑴、甲證11第6頁第1段揭露一種式I化合物，其4－甲基－N－[3－(4－
甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺，甲證11第11頁第4至8行另揭露該式I化合物可為醫藥上可接受之鹽，而該鹽可為式I化合物與有機酸或無機酸所形成之酸加成鹽，並例示該無機酸包括鹽酸，可用以治療神經方面之疾病（甲證11摘要），甲證12第130頁之圖1A揭露一種化合物AMN107，即甲證11之式I化合物，甲證12第134頁之圖4B及第135頁表2進一步揭露AMN107之鹽酸鹽，可用以治療慢性骨髓性白血病（甲證12摘要），甲證13摘要則揭露AMN107可用於治療慢性骨髓性白血病，是以，甲證11至13均揭露AMN107化合物及可用於醫藥用途，具有技術領域之關連性，故該發明所屬技術領域中具有通常知識具有合理動機組合甲證11至13。
⑵、系爭專利請求項2至3範圍業如前述，按西元2020年專利審查
基準第二篇發明專利實體審查第13章醫藥相關發明5.3.1.4水合物記載「申請專利之發明為一種已知化合物之特定含水數的水合物。對於醫藥產物而言，不同含水數對藥物之溶解度、溶解速度及生體可用率、製劑之化學安定性及物理安定性等均有影響，若該發明所屬技術領域中具有通常知識者於確認或預期該化合物有水合物存在之情況下，有動機尋找較佳含水數，並以例行之實驗方法即可獲得該較佳含水數之水合物，則原則上該已知化合物之水合物發明不具進步性，除非申請人能提供請求之水合物具有無法預期功效的證據或其他理由足以證明請求之水合物具有進步性」。另按，專利專責機關（即被告）對專利有效性案件，為求審查迅速，公平正確，依職權訂定專利審查基準供其指定之審查人員有明確之遵循標準。依我國現行行政程序法對行政命令僅分為法規命令及行政規則的二分法，專利審查基準既為主管機關為規範內部審查作業而依職權所頒訂之非直接對外發生效力之一般、抽象規定，屬於行政規則（行政程序法第159條第1項參照）。雖然審查基準之內容並非只有單一內容，有解釋性之行政規則，也有作為判斷基準之行政規則，甚至有裁量性的基準。不過既為行政規則，依憲法第80條規定，行政法院法官關於法律的適用，應有正確闡釋之必要，自應本於其確信，對於法律規定表示合法適當之法律見解，當然不受行政機關所訂定之行政規則之拘束；易言之，客觀法律解釋權限，應歸屬法院而非行政機關。法院對於法律解釋應有最終具有拘束性的解釋權，法院作成的裁判也應基於其自身對法律的確信，不應受行政機關訂定行政規則之拘束，行政規則也不應成為審判時法律基準（但若係裁量基準，則因基於平等原則所衍生之行政自我拘束原則應予除外）。縱使法院引用審查基準內容文字，亦係基於法院自身對法律的確信，所表示合法適當之法律見解而為法院作成之法律解釋內容，並非受行政機關訂定行政規則之拘束，審查基準內容有所變更或修訂，法院仍應依其確信，為妥當之法律解釋，不受前後變更之影響。所以專利審查基準修訂或變更，並不發生適用法規基準時問題。法院如認為修正後之專利審查基準僅係明確法條適用、補充闡明，與核准時專利法之規範並不相違，而參酌修正後審查基準據以判斷系爭專利進步性，亦無不可（最高行政法院109年上字第914號判決意旨參照）。
⑶、系爭專利核准時之醫藥相關發明基準，並未有針對醫藥化合
物的水合物型態之進步性判斷有所闡明，直至西元2020年版之醫藥相關發明基準方有對其水合物型態之進步性判斷揭露相關原則，基於核准時之醫藥相關發明基準未有醫藥化合物水合物之進步性判斷原則，只要與核准時之專利法規範不違背之情形下，自當可進一步參考2020年版醫藥相關發明基準對於醫藥化合物水合物之進步性的補充闡明。甲證11第6頁第1段揭露一種式I化合物，其4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺，甲證11第11頁第4至8行另揭露該式I化合物可為醫藥上可接受之鹽，而該鹽可為式I 化合物與有機酸或無機酸所形成之酸加成鹽，並例示該無機酸包括鹽酸。甲證12第130頁之圖1A揭露一種化合物AMN107，即為甲證11之式I化合物（兩造並無爭執），甲證12第134頁之圖4B及第135頁表2進一步揭露AMN107之鹽酸鹽（AMN107-HC1）的藥物動力學數據。甲證13摘要則揭露AMN107可用於治療慢性骨髓性白血病，甲證13第4942頁右欄第11行進一步揭露所使用之AMN107為AMN107單鹽酸鹽。是以，該發明所屬技術領域中具有通常知識者參酌甲證11至13可理解「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺」之鹽酸鹽已屬先前技術（即為AMN107鹽酸鹽），與系爭專利請求項2至3之差異在於未揭露「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺」之鹽酸鹽『二水合物之結晶型A』，惟該發明所屬技術領域中具有通常知識者可理解先前技術僅揭露「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽』與『4-甲基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺鹽酸鹽二水合物結晶型A」結構上具有二水合物之差異，故二者係為結構不同之化合物，又醫藥化合物水合物之生成，在於溶解於水中受到水分子吸引作用向水中擴散，並與水分子水合，當外界條件改變時，會從溶液中析出晶體，有些水合分子相對結合比較牢固，結晶時會克服溶液中大量水分子吸引力作用，而將其結合之水分子隨著結晶析出而帶有結晶水，而該等水合物形成關鍵亦在於水分子是否與該醫藥化合物以氫鍵方式產生相互作用，惟查甲證11至13均未揭露4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽是否可確認或合理預期具有「水合物」之形式，亦未揭露醫藥開發過程，探討水合物形成之可能性，及製備水合物，對於藥物之溶解度、溶解速度及生體可利用率、製劑之化學及物理的安定性之影響，故該發明所屬技術領域中具有通常知識者參酌甲證11至13之內容尚難謂有合理動機且可經一般例行性試驗而完成4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽之二水合物形式，遑論評估該二水合物之各種結晶型對於藥物開發及製造過程之影響進而完成其結晶型A，故甲證11至13之組合不足以證明系爭專利請求項2至3不具進步性。
５、甲證11至14、17之組合不足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性：
⑴、甲證14第31頁倒數第5至6行揭露式（I）通式化合物（包括鹽
類）可為水合物，亦可呈結晶型式，其中實施例92化合物則為該式（I）通式化合物之下位概念，且與「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺」（即為AMN107），可用治療白血病（甲證14摘要），甲證17第4501頁左下欄揭露NVP-AMN107-AA（即為AMN107鹽酸鹽），可用以治療imatinib反應不佳之慢性骨髓性白血病（甲證17摘要最後1行），承上述，甲證11至14、17均揭露AMN107化合物及可用於醫藥用途，具有技術領域之關連性，故該發明所屬技術領域中具有通常知識具有合理動機組合甲證11至14、17。
⑵、如前所述，甲證11至13已揭露「4－甲基－N－[3－(4－甲基
－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽」，但未揭露該化合物是否有水合物存在之預期，查甲證14（編碼為14-1）第31頁倒數第5至6行揭露式（I）通式化合物（包括鹽類）可為水合物，亦可呈結晶型式，其中實施例92化合物則為該式
（I）通式化合物之下位概念，且與「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺」（兩造無爭執）相同，但查甲證14內容並未有任何關於式（I）通式化合物可製備水合物之實例，故前開式（I）通式化合物之鹽類可為水合物僅為籠統敘述並無法認定為甲證14有針對式（I）通式化合物是否可產生水合物形式進行研究探討，自當無法確認或預期該實施例92化合物之鹽酸鹽具有水合物存在，又，甲證17第4501頁左下欄揭露NVP-AMN107-AA（即為AMN107鹽酸鹽），雖查甲證18第163頁補強證據（Pharmacological Review of Nilotinib downloaded from USFDA published on 29 Oct. 2007）揭露該NVP-AMN107-AA係指AMN107鹽酸鹽單水合物，二者定義有所不同，惟就其甲證17所揭露之NVP-AMN107-AA解釋，當以甲證17所定義為主，不應參考甲證18所記載者，是以，該發明所屬技術領域中具有通常知識者參酌甲證11至14、17無法確認或預期4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽」具有水合物存在，亦無動機於醫藥開發過程，探討水合物形成之可能性，及評估水合物，對於藥物之溶解度、溶解速度及生體可利用率、製劑之化學及物理的安定性之影響，故「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽之二水合物」非屬該發明所屬技術領域中具有通常知識者具有合理動機且經一般例行性試驗而可輕易完成，遑論評估該二水合物之各種結晶型對於藥物開發及製造過程之影響進而完成其結晶型A，故甲證11至14、17之組合不足以證明系爭專利請求項2至3不具進步性。
６、甲證11至14、17、19之組合不足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性：
甲證19係含有關藥學上可接受陰離子之NH+鹽類的水合物形成的劍橋晶體資料庫調查文獻，與甲證11至14、17所揭露內容，均為醫藥領域之相關技術，具有技術領域之關連性，故該發明所屬技術領域中具有通常知識具有合理動機組合甲證11至14、17、19。承上所述（即５、⑵部分），甲證19第342頁右欄第3.1節揭露「所有陽離子亞組中，鹵化物鹽出現率很高，在消耗其他陰離子基團上，三級胺和環胺中鹵化鹽出現增加」，第344頁右欄第1至2行揭露鹵素離子相較於羧酸離子（鹵素離子與羧酸離子均為陰離子）有高度可能被水合化，即當陰離子為鹵化物時，鹵素離子與陽離子形成鹵化物鹽比羧酸鹽更容易水合，查「4-甲基-N-[3-（4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-（4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺」雖具有2級胺及環胺結構，然甲證19圖4揭露鹵素離子與2級胺與環胺結構之陽離子結構形成鹵化物鹽之水合比例僅約為13至29％左右（參圖4紫色柱狀圖形於2°amine及cyclic amine所對應縱軸之水合物百分比），惟該發明所屬技術領域中具有通常知識者參酌甲證17、19內容仍無法確認或預期「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽」具有水合物存在，綜上，該發明所屬技術領域中具有通常知識者參酌甲證11至14、17、19無法確認或預期4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽」具有水合物存在，亦無動機於醫藥開發過程，探討水合物形成之可能性，及評估水合物，對於藥物之溶解度、溶解速度及生體可利用率、製劑之化學及物理的安定性之影響，故「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽之二水合物」非屬該發明所屬技術領域中具有通常知識者具有合理動機且經一般例行性試驗而可輕易完成，遑論評估該二水合物之各種結晶型對於藥物開發及製造過程之影響進而完成其結晶型A，故甲證11至1
4、17、19之組合不足以證明系爭專利請求項2至3不具進步性。
７、甲證11至14、17、20之組合不足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性：
⑴、甲證20第132頁2.1Hydrochloirides係探討對於鹼性醫藥化合
物可與鹽酸反應製備該醫藥化合物鹽酸鹽，與甲證11至14、17所揭露內容，均為醫藥領域之相關技術，具有技術領域之關連性，故該發明所屬技術領域中具有通常知識者有合理動機組合甲證11至14、17、20。
⑵、甲證11至14、17所揭露者，如前所述，該發明所屬技術領域
中具通常知識者可理解，系爭專利請求項2及3之「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽」屬系爭專利優先權日前之先前技術，查甲證20第132頁2.1Hydrochloirides係探討對於鹼性醫藥化合物可與鹽酸反應製備該醫藥化合物鹽酸鹽，並未特定揭露前開系爭專利請求項2及3之化合物具有水合物之存在，亦無揭露於醫藥開發過程，探討水合物形成之可能性，及評估水合物，對於藥物之溶解度、溶解速度及生體可利用率、製劑之化學及物理的安定性之影響，準此，該發明所屬技術領域中具有通常知識者參酌甲證11至14、17、20無法確認或預期4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽」有水合物存在，亦無合理動機且可經一般例行性試驗而完成4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽之二水合物形式，遑論評估該二水合物之各種結晶型對於藥物開發及製造過程之影響進而完成其結晶型A，從而甲證11至14、17、20之組合不足以證明系爭專利請求項2及3不具進步性。
８、甲證11至14、17、21之組合足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性：
⑴、甲證21圖6揭露藥物開發過程（因應藥物查驗登記審查為目的
），研究人員應評估所研究之醫藥化合物是否具有水合物或溶劑合物存在，與甲證11至14、17所揭露內容，均為醫藥領域之相關技術，具有技術領域之關連性，故該發明所屬技術領域中具有通常知識者有合理動機組合甲證11至14、17、21。
⑵、甲證11至14、17所揭露者，如前所述，特別是該發明所屬技
術領域中具通常知識者參酌甲證11可理解，系爭專利請求項2及3之「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽」屬系爭專利優先權日前之先前技術，且甲證11請求項8揭露前開化合物可用以治療神經血管相關疾病，查甲證21揭露藥物物質固體之查驗登記法規考量之策略性方法（參標題），食品藥物管理局之藥物物質指導方針，要求使用適當分析方法測量藥物物質多晶型、水合或非晶型態，因為控制藥物物質晶型具有重要性，且申請人有責任控制藥物物質晶型，假如生體可用率受到影響，並須證明控制方法的適當性（參甲證21第945頁左欄第1段），考量甲證21第946頁左欄第3段（參甲證21-1中文翻譯）揭露「4種決策樹係描述在以下部分：『多晶型物』、『水合物（溶劑合物）』、去溶劑化之溶劑合物及非結晶型式。當藥物物質以不同的晶體堆積排列結晶且所有的排列都具有相同的元素成分時，會存在多晶型物（注意：水合物也可以存在於多晶型物中）………如前所述，建議調查藥物物質是否存在多晶型或水合物，因為在製藥過程的任何階段或儲存藥物物質或劑型都可能遇到此些問題」，甲證21圖6揭露藥物開發過程（因應藥物查驗登記審查為目的），研究人員應評估所研究之醫藥化合物是否具有水合物或溶劑合物存在（使用不同再結晶溶劑，測試不同參數，如：溫度、濃度及pH值，並利用X粉末繞射法測試鑑別）並研究水合物之物化特性，如穩定性及溶解度，此為藥物開發之標準流程，是以，該發明所屬技術領域中具有通常知識者若以「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽」為醫藥化合物研究開發之起點，當會評估是否存在水合物，若存在水合物，亦會評估該各種水合物之溶解度與穩定性等物化特性，藉以評估該水合物於藥物製劑開發是否具有優勢，準此，該發明所屬技術領域中具有通常知識者參酌甲證21可理解以例行性試驗測試「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽」是否有水合物存在，並接續執行一系列例行性試驗瞭解其各種水合物之物化特性（如：穩定性），並為優化其物化特性進而尋找出最適合者，故「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽二水合物」為該發明所屬技術領域中具有通常知識者參酌甲證11、21內容後，有合理動機經一般例行性試驗而輕易完成。
⑶、又核准時之專利審查基準第二篇發明專利實體審查第13章醫
藥相關發明5.3.1.3化合物多晶型之進步性記載「申請專利之發明為一種已知化合物的多晶型，因多晶型的分子結構係與該化合物完全相同，僅結晶型態有所不同，且多晶型通常以『例行之實驗方法』即可獲得，故原則上已知化合物的多晶型不具進步性，除非該多晶型較該已知化合物具有無法預期的功效。……」，查系爭專利說明書第6頁第9至11行【先前技術】揭露「多晶型現象表示物質存在一種以上晶體結構。化學物質以一種以上晶體變型結晶之能力對藥物的貯存期限、溶解度、調配物性質及加工性質具有深遠影響」，第7頁倒數第1至2行【先前技術】揭露「一旦選擇，重要之處在於在所研究劑型中多晶型可再現性製備且長時間保持不變」，故該發明所屬技術領域中具有通常知識者可理解化合物結晶型之物化性質對於藥物開發過程期間相當重要，必須具有優良的溶解度、調配物性質、加工性質、製備再現性及穩定性，甲證21圖1揭露藥物開發過程（因應藥物查驗登記審查為目的），研究人員應評估所研究之醫藥化合物是否具有多晶型物存在（使用不同再結晶溶劑，測試不同參數，如：溫度、濃度及pH值，並利用X粉末繞射法測試鑑別）並研究多晶型物之物化特性，故自會有合理動機於藥物開發過程中尋找適當結晶型，而系爭專利說明書第49頁第3至11行揭露「亦進一步對4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽之結晶型A、結晶型B、結晶型C及非結晶型之全部實施穩定性研究。對於結晶型A、B及C，在不同相對濕度下貯存後未觀察到形式轉變；而該鹽酸鹽之非結晶型自發結晶為結晶型A。此外，每一結晶型皆具有良好的化學穩定性，50℃時保持1個月，80℃時保持1個月且在80℃及75%相對濕度下保持1個月，但結晶型C及非結晶型二者在上述最後一種條件下顯示為與結晶型A之混合物」，該發明所屬技術領域中具有通常知識者可理解結晶型A具有儲存之安定性，承上述，雖然「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽二水合物」並未明確揭露於先前技術中，非屬醫藥相關發明基準5.3.1.3化合物多晶型之進步性規定中「已知化合物」，惟「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽二水合物」可經由一般例行性試驗完成，已如前述，故該化合物並未有進步性可言，基於醫藥相關發明基準5.3.1.3化合物多晶型之進步性規定中相同結構之二種以上之多晶型，可經由一般例行性試驗而完成，當以「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽二水合物」為研究起點，當具有合理動機經一般例行性試驗而完成純淨之前開化合物具有穩定性之結晶型A，並以X粉末繞射法數值界定該結晶型A，又考量製備「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽二水合物結晶型A」作為藥物原料，自然對於該原料純度之要求極高，盡量不得有不純物，當可完成「大體上純淨」之「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽二水合物結晶型A」。
⑷、再者，核准時之專利審查基準第二篇發明專利實體審查第3章
專利要件3.4.2.1發明具有無法預期之功效記載「無法預期之功效包含產生新的特性或在數量上的顯著變化。若申請專利之發明對照先前技術具有無法預期之功效，而其係該發明之技術特徵所導致時，該無法預期之功效得佐證該發明並非能輕易完成。因此，即使申請時之通常知識或先前技術會促使該發明所屬技術領域中具有通常知識者組合、修飾、置換或轉用先前技術所揭露之內容而完成申請專利之發明，但若該先前技術並未揭露組合、修飾、置換或轉用後會產生無法預期之功效時，則申請專利之發明仍非能輕易完成」等內容，查甲證8（系爭專利權人於專利申請階段提交之申復理由書）記載於活體動物（狗）生體利用率試驗，「鹽酸鹽單水合物」所呈現的生體利用率較「游離鹼」高出13倍以上，惟本件之證據組合所揭露之先前技術為「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽」，系爭專利請求項2及3之發明為「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽二水合物結晶型A」，就系爭專利之發明與先前技術之對照而論，甲證8所提供之數據並無法證明「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽二水合物結晶型A」相較於「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽」具有無法預期之功效。
⑸、參加人雖主張「將12克4-甲基-N-[3-(4-甲基-咪唑-1-基）-5
-三氟甲基-苯基]-3-(4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺鹽酸鹽在52°C下溶於192毫升甲醇及21毫升水中。使該溶液在10分鐘内加熱至64至66°C且使其靜置45分鐘。然後使該溶液於3小時内冷卻至0°C。由於0°C之前該溶液自發結晶，因而在20°C時停止斜坡冷卻並在攪拌下將其放置2天。使該懸浮液於2小時内冷卻至0°C，然後在真空下過濾以得到4-甲基-N-[3-(4-甲基-咪唑-1-基）-5-三氟甲基-苯基]-3-(4-吡啶-3-基-嘧啶-2-基胺基）-苯甲醯胺鹽酸鹽之結晶型A」，其等並非審查基準所述之「例行之實驗方法」云云，查甲證21圖1揭露藥物開發過程（因應藥物查驗登記審查為目的），研究人員應評估所研究之醫藥化合物是否具有多晶型物存在（使用不同再結晶溶劑，測試不同參數，如：溫度、濃度及pH值，並利用X粉末繞射法測試鑑別）並研究多晶型物之物化特性，故實施例19中關於將「4－甲基－N－[3－(4－甲基－咪唑－1－基)－5－三氟甲基－苯基]－3－(4－吡啶－3－基－嘧啶－2－基胺基)－苯甲醯胺鹽酸鹽」於特定溶劑中，在經過加熱、冷卻等步驟方能獲得該結晶型A，均屬甲證21圖1所教示範圍，且僅為重覆測試試驗之過程，當屬基準所規定之「例行之實驗方法」。
⑹、是以甲證11、21之組合既足以證明系爭專利請求項2及3不具
進步性，從而，甲證11至14、17、21之組合亦足以證明系爭專利請求項2及3不具進步性。
９、甲證11至14、17、19、20、21之組合足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性：
⑴、承上述，甲證11至14、17分別與甲證19、20、21具有技術領
域之關連性，是以，該發明所屬技術領域中具有通常知識者，當具有合理動機組合甲證11至14、17、19、20、21。
⑵、再者，基於甲證11至14、17、21之組合足以證明系爭專利請
求項2及3不具進步性，該發明所屬技術領域中具有通常知識者亦可理解甲證11至14、17、19、20、21之組合足以證明系爭專利請求項2及3不具進步性。
七、綜上所述，系爭專利請求項2、3對應之說明書內容違反核准時專利法第26條第1項（可據以實現要件）之規定；系爭專利請求項2、3違反核准時專利法第26條第2項（明確要件）；系爭專利請求項2、3違反核准時專利法第26條第2項（支持要件）；甲證11至14、17、21之組合足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性；甲證11至14、17、19、20、21之組合足以證明系爭專利請求項2、3不具進步性。從而，原處分關於「請求項2至3舉發不成立」部分之審定，有所違誤，訴願決定予以維持，亦有未合，原告起訴請求撤銷訴願決定及原處分關於「請求項2至3舉發不成立」部分，並命被告就上開請求項應作成舉發成立之處分，為有理由，應予准許。
八、本件事證已明，兩造及參加人其餘主張或答辯，均核與本院判決結果不生影響，爰毋庸一一論列，併此敘明。
據上論結，原告之訴為有理由，爰依智慧財產案件審理法第1條，行政訴訟法第98條第1項前段，判決如主文。
中 華 民 國 111 年 9 月 30 日
智慧財產第三庭
審判長法 官 彭洪英
法 官 林怡伸法 官 林惠君以上正本係照原本作成。
如不服本判決，應於送達後20日內，向本院提出上訴狀並表明上訴理由，其未表明上訴理由者，應於提起上訴後20日內向本院補提上訴理由書；如於本判決宣示後送達前提起上訴者，應於判決送達後20日內補提上訴理由書（均須按他造人數附繕本）。
上訴時應委任律師為訴訟代理人，並提出委任書（行政訴訟法第241條之1第1項前段），但符合下列情形者，得例外不委任律師為訴訟代理人（同條第1項但書、第2項）。
┌─────────┬────────────────┐│得不委任律師為訴訟│ 所 需 要 件 ││代理人之情形 │ │├─────────┼────────────────┤│一符合右列情形之一│1.上訴人或其法定代理人具備律師資││ 者，得不委任律師│ 格或為教育部審定合格之大學或獨││ 為訴訟代理人 │ 立學院公法學教授、副教授者。 ││ │2.稅務行政事件，上訴人或其法定代││ │ 理人具備會計師資格者。 ││ │3.專利行政事件，上訴人或其法定代││ │ 理人具備專利師資格或依法得為專││ │ 利代理人者。 │├─────────┼────────────────┤│二非律師具有右列情│1.上訴人之配偶、三親等內之血親、││ 形之一，經最高行│ 二親等內之姻親具備律師資格者。││ 政法院認為適當者│2.稅務行政事件，具備會計師資格者││ ，亦得為上訴審訴│ 。 ││ 訟代理人 │3.專利行政事件，具備專利師資格或││ │ 依法得為專利代理人者。 ││ │4.上訴人為公法人、中央或地方機關││ │ 、公法上之非法人團體時，其所屬││ │ 專任人員辦理法制、法務、訴願業││ │ 務或與訴訟事件相關業務者。 │├─────────┴────────────────┤│是否符合一、二之情形，而得為強制律師代理之例外，上訴││人應於提起上訴或委任時釋明之，並提出二所示關係之釋明││文書影本及委任書。 │└──────────────────────────┘中 華 民 國 111 年 9 月 30 日
書記官 張玫玲